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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000466`

染色体: Chr02 坐标: 6293513-6297640 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000466`
名称	SmilChr02G000466
描述	uncharacterized SmilChr02G000466
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6293513 - 6297640 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012840`
GeneID	`131012840`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012840`
原始查询	`LOC131012840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1705_C03.129; symbol=OJ1705_C03.129; hit=Os08g0377500; species=rice; confidence=high
产物	OJ1705_C03.129; symbol=OJ1705_C03.129; hit=Os08g0377500; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G46060` (AT5G46060) spastin, putative (Protein of unknown function, DUF599) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834647] identity=54.1; qcov=0.986; evalue=5.43e-68; confidence=high
Rice	`Os08g0377500` (OJ1705_C03.129) - identity=57.4; qcov=0.977; evalue=3.13e-91; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04654 (DUF599)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012840

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057796812.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057796810.1`
3	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057796810.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.40000	`XP_057796812.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057796812.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6294040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B93
`Chr2:6294157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr2:6294446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	151	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A23,A4,A7,A8,B10,B101,B102,B104,B105,B108,B109,B110,B111,B113,B114,B117,B118,B12,B120,B121,B123,B125,B126,B127,B129,B133,B137,B138,B140,B16,B17,B19,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B49,B50,B53,B55,B56,B57,B6,B60,B61,B66,B67,B70,B71,B72,B73,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B85,B86,B88,B9,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C14,C15,C16,C17,C2,C22,C23,C27,C30,C31,C33,C34,C35,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C48,C49,C5,C50,C53,C54,C56,C57,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C70,C72,C74,C76,C78,C8,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D5,D7,D8
`Chr2:6296553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:6296902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B23,B55,B90,B92
`Chr2:6297120`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B124,C42,D8
`Chr2:6297166`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C86
`Chr2:6297334`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A25,C1,C51,C65,C80
`Chr2:6297334`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A25,C1,C51,C65,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796810.1

258 aa

129

258

DUF599

PF04654 DUF599 13-217 aa

XP_057796811.1

255 aa

128

255

DUF599

PF04654 DUF599 13-214 aa

XP_057796812.1

221 aa

110

221

DUF599

PF04654 DUF599 12-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796810.1`	Pfam	`PF04654`	DUF599	Family	13	217	4.9e-49	167.3	Protein of unknown function, DUF599
`XP_057796811.1`	Pfam	`PF04654`	DUF599	Family	13	214	5.5e-50	170.4	Protein of unknown function, DUF599
`XP_057796812.1`	Pfam	`PF04654`	DUF599	Family	12	213	1.4e-60	205.0	Protein of unknown function, DUF599

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940829.1
GAAATCTGCATGATTAAAGCATCCCACGTCGGCTACAGCTAAAACTCTCACAACAAGAAACTAAAAAAAGAGAGGCTATCTTGAGCAAAACTCAACTACTACATAGCATGGCAACGCAACTTAAAAGTAAACAACCCCACGAAATCTAAGTCGTCGTATTATTTCCAAGAACCCAATACAAACACGAGAGCCAAAAAAAGTGCATAATGGTGCAGTGGAAGAAAGAGTACTTAGATCTCATATTAGTTCCATGCGGTTTG...

XM_057940827.1
GGCAACCATTAATCTCTACGAAATCATAAATGAAGGATCAAAAACTATATTCATCTAGGAGTAGGAGCTTTAGAAATGGGGCCGACATGGAAGAAAGAATACTTGGATTTTGTTCTAGTCCCAGGCGGTTTACTAGTCATGCTCGGATACCATCTGTTTCATCTCCACAGATGTATTAATCGGGCCGAGACCACGGTCGTTGGATACGAAAACTACAACAGGAGAGTTTGGGTATCAAGAGTGTTGGAGAGTTTGCAGGT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012840
ATGGTGCAGTGGAAGAAAGAGTACTTAGATCTCATATTAGTTCCATGCGGTTTGCTCCTTATGTTGGGATATCATCTCGTCCTCGTCTATCGCTACCTCAAATGCCCTCAAAACACCATCATCGGCTACGAGAATCACAACAAGAGAGCTTGGGTTAGAAAAATGTTTCAGATCAAAATCGAGGACAGGGGGCCTGCAATATCGGTGCTGAGCAGCAACGCGAGTGCAGCGACGTCCCTGGCATCGATTTCGTTGGTTCT...

LOC131012840
ATGGGGCCGACATGGAAGAAAGAATACTTGGATTTTGTTCTAGTCCCAGGCGGTTTACTAGTCATGCTCGGATACCATCTGTTTCATCTCCACAGATGTATTAATCGGGCCGAGACCACGGTCGTTGGATACGAAAACTACAACAGGAGAGTTTGGGTATCAAGAGTGTTGGAGAGTTTGCAGGTTGAAGTAAAGGATAGAGATCAAGCACTTACAGTGATGGGGAACTACTTATCTGCAGCAATGTCTCTGGCCTCCAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796810.1
MGPTWKKEYLDFVLVPGGLLVMLGYHLFHLHRCINRAETTVVGYENYNRRVWVSRVLESLQVEVKDRDQALTVMGNYLSAAMSLASIALALSSFIGAWIGSTYHGEVLGARVYGNTSSTMVYIKYVAILSSFMIAFACFVHAATSFLHAGFLISLPNCVMPPGNVESAVITGSNFWVVGLRSLYLATNLLLWIFGPIPMFVSSVITVVLLQYLDRNSIPFPQYDRPQSYDSFKKIDDREESGDSLNGTSSLLPTPLRT

XP_057796811.1
MGPTWKKEYLDFVLVPGGLLVMLGYHLFHLHRCINRAETTVVGYENYNRRVWVSRVLEVEVKDRDQALTVMGNYLSAAMSLASIALALSSFIGAWIGSTYHGEVLGARVYGNTSSTMVYIKYVAILSSFMIAFACFVHAATSFLHAGFLISLPNCVMPPGNVESAVITGSNFWVVGLRSLYLATNLLLWIFGPIPMFVSSVITVVLLQYLDRNSIPFPQYDRPQSYDSFKKIDDREESGDSLNGTSSLLPTPLRT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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