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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000483`

染色体: Chr02 坐标: 6600488-6602111 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000483`
名称	SmilChr02G000483
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	6600488 - 6602111 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012851`
GeneID	`131012851`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012851`
原始查询	`LOC131012851`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UPF0481 protein At3g02645
产物	putative UPF0481 protein At3g02645
Arabidopsis	`AT4G31980` (AT4G31980) PPPDE thiol peptidase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829328] identity=33.2; qcov=1.04; evalue=5.97e-49; confidence=low
Rice	`Os01g0562600` - identity=29.2; qcov=1.03; evalue=3.05e-38; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03140 (DUF247)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012851

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057796822.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796822.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057796822.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796822.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796822.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:6600834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr2:6600837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B53,B85,C6
`Chr2:6600941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B7,C11,C12,C69
`Chr2:6601187`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A19,A2,B117,B74,B94,C53,D4
`Chr2:6601215`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:6601216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr2:6601224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B98,C87
`Chr2:6601330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:6601363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr2:6601764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C52
`Chr2:6601813`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,C52
`Chr2:6601834`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C52,C56,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796822.1

406 aa

203

406

DUF247

PF03140 DUF247 30-397 aa

XP_057796823.1

381 aa

190

381

DUF247

PF03140 DUF247 30-306 aa PF03140 DUF247 311-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796822.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	397	3.6e-105	353.3	Plant protein of unknown function
`XP_057796823.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	30	306	2.7e-89	301.0	Plant protein of unknown function
`XP_057796823.1`	Pfam	`PF03140`	DUF247	Family	311	372	2.7e-89	301.0	Plant protein of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940839.1
TACAATAATGCAAAGATGGGAAGGGAAGAAAGCTCTTTAAAAAGAAAATAGCGCGAAGAAATCAGCTGCAGCAACCACGACAGCTTAAGGTGCACTAGTTTCTCAAACTTTTATCGTCTGAGGAGCTCTGCTGCTAATCTACATATATATTTTCTGGTTTCTTGGTTTAGTTCTTGAAGATGACAGAGGAGAGAGATTGTGTTACTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTGATCATTTGTCTGCTTCTTTCACTCCCTCAAAG...

XM_057940840.1
TACAATAATGCAAAGATGGGAAGGGAAGAAAGCTCTTTAAAAAGAAAATAGCGCGAAGAAATCAGCTGCAGCAACCACGACAGCTTAAGGTGCACTAGTTTCTCAAACTTTTATCGTCTGAGGAGCTCTGCTGCTAATCTACATATATATTTTCTGGTTTCTTGGTTTAGTTCTTGAAGATGACAGAGGAGAGAGATTGTGTTACTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTGATCATTTGTCTGCTTCTTTCACTCCCTCAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012851
ATGACAGAGGAGAGAGATTGTGTTACTGTTAGGATTGAAAACTTGCTTGATCATTTGTCTGCTTCTTTCACTCCCTCAAAGCCTATCATAGCTAAAGTGGATCAACACCTAAGGCAAGCAAACGAAAAGGATTTTGAACCCGAAATAGTTTCTATAGGTCCAATTCATCGTGGGAAAGATCGCGTTAAGGGCATGGAGCAACACAAGCTGAGGTATCTAAGAAAAGTAGTAGGAAGAAGAGATGAGTTGAGCATTGAGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796822.1
MTEERDCVTVRIENLLDHLSASFTPSKPIIAKVDQHLRQANEKDFEPEIVSIGPIHRGKDRVKGMEQHKLRYLRKVVGRRDELSIEKCVLEVRSMEQKARLYYPKSISLDQDEFVEMLLLDGCFVIELLRSYWFSDLRDKNDQIFQFDHMLAQIRHDLLLLENQLPFFVLNELFDMTKMEDPDDNIHDLLLFLAGDALPWPDSSKLDSSSDMLHNAEHLLGLVYDSCFSFSFSAKHFTENNGSNTVHHTYSASEMEEGGI...

XP_057796823.1
MTEERDCVTVRIENLLDHLSASFTPSKPIIAKVDQHLRQANEKDFEPEIVSIGPIHRGKDRVKGMEQHKLRYLRKVVGRRDELSIEKCVLEVRSMEQKARLYYPKSISLDQDEFVEMLLLDGCFVIELLRSYWFSDLRDKNDQIFQFDHMLAQIRHDLLLLENQLPFFVLNELFDMTKMEDPDDNIHDLLLFLAGDALPWPDSSKLDSSSDMLHNAEHLLGLVYDSCFSFSFSAKHFTENNGSNTVHHTYSASEMEEGGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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