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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000522`

染色体: Chr02 坐标: 7177294-7179078 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000522`
名称	SmilChr02G000522
描述	receptor-like protein 35
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	7177294 - 7179078 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012877`
GeneID	`131012877`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012877`
原始查询	`LOC131012877`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 35
产物	receptor-like protein 35
Arabidopsis	`AT3G47570` (AT3G47570) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823911] identity=41.8; qcov=0.842; evalue=6.31e-41; confidence=medium
Rice	`Os02g0216000` (B1307A11.13) - identity=40.6; qcov=0.887; evalue=2.65e-42; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012877

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796849.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796849.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796849.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796849.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796849.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:7177366`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B117,C27,C33,C38
`Chr2:7177366`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B117,C27,C33,C38
`Chr2:7177385`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A15,B121,B20,B33,B61,C56,C71
`Chr2:7177396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	B107,B126,B32,B57,B73,B78,B8,C16,C19
`Chr2:7177401`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B125,B84,B95
`Chr2:7177401`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B125,B84,B95
`Chr2:7177403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B32,B48,B78,C56
`Chr2:7177416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,D5
`Chr2:7177461`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr2:7177462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B100,B94
`Chr2:7177477`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	209	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr2:7177478`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	208	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B121,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B135,B136,B138,B140,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B37,B38,B39,B40,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B75,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C52,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C68,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C8,C82,C83,C84,C85,C86,C87,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796849.1

247 aa

124

247

LRRNT_2

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 28-68 aa PF00560 LRR_1 75-95 aa PF00560 LRR_1 98-117 aa PF00560 LRR_1 125-146 aa PF00560 LRR_1 148-169 aa PF00560 LRR_1 172-194 aa PF00560 LRR_1 196-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	28	68	4.1e-08	34.1	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	75	95	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	117	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	125	146	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	148	169	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	172	194	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat
`XP_057796849.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	196	218	1.6e-21	72.4	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940866.1
TTCTTGTTTGCGCACATAATTACAGTTAATTAGCACTCTGCATTCACAATATGGAGAGAGTTTCTCTAATTTTCCTACATTCTCTACTCATGTTGTTTTCTTGGCTTACCCTTGCTACGACTGATCAAATCAAAAGTGATGAATCTTCACTTCTTGCCCTCAAATCCCGCATCACTTCAGATCCCGACAATTATTTGAAAAATAATTGGACCATCGGAACCTCCATTTGCACATGGATAGGAGTTACGTGTGATTCACGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012877
ATGGAGAGAGTTTCTCTAATTTTCCTACATTCTCTACTCATGTTGTTTTCTTGGCTTACCCTTGCTACGACTGATCAAATCAAAAGTGATGAATCTTCACTTCTTGCCCTCAAATCCCGCATCACTTCAGATCCCGACAATTATTTGAAAAATAATTGGACCATCGGAACCTCCATTTGCACATGGATAGGAGTTACGTGTGATTCACGTGATAGTAGGGTGACTGCTTTAGATCTCTCATATATGGGACTCGAAGGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796849.1
MERVSLIFLHSLLMLFSWLTLATTDQIKSDESSLLALKSRITSDPDNYLKNNWTIGTSICTWIGVTCDSRDSRVTALDLSYMGLEGSIPPEIGNLSFLVSLDLSLNSLCGPLPKDICRHNNLQRLEALYLFSNKLEGEIPLSLGECPQLEFINLSYNNFGGHVPSQIGNITQLKALDLSWNNQRGTIPKEIGNLHNLRYMKLESNQLIGSIPREVGNMTALFELQLRNNSLSGMIYYSPSHKFSYSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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