当前解析结果
SmilChr02G000548| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000548 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000548 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000548 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 7596257 - 7597518 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012897 |
|---|---|
| GeneID | 131012897 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012897 |
| 原始查询 | LOC131012897 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012897 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796860.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057796860.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057796860.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796860.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796860.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:7596465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B115,B65,C20 |
Chr2:7596468 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 11 | A20,B10,B106,B19,B21,B49,B52,B83,C3,C59,C7 |
Chr2:7596477 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 12 | A18,B110,B111,B126,B138,B17,B39,B60,B66,C30,C58,D1 |
Chr2:7596491 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A24,B46,B87,C4,C80 |
Chr2:7596496 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B67,C4 |
Chr2:7596507 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B108,B4 |
Chr2:7596509 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B23 |
Chr2:7596511 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 2 | B78,D9 |
Chr2:7596511 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 2 | B78,D9 |
Chr2:7596515 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B75 |
Chr2:7596519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B5,B85 |
Chr2:7596519 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B5,B85 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。