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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000572`

染色体: Chr02 坐标: 8088579-8181043 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000572`
名称	SmilChr02G000572
描述	zinc transporter ZTP29-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8088579 - 8181043 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012914`
GeneID	`131012914`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012914`
原始查询	`LOC131012914`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc transporter ZTP29-like
产物	zinc transporter ZTP29-like
Arabidopsis	`AT3G20870` (AT3G20870) ZIP metal ion transporter family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821636] identity=86.1; qcov=0.947; evalue=9.17e-36; confidence=medium
Rice	`Os02g0196000` - identity=88.9; qcov=0.947; evalue=1.29e-36; confidence=medium
GO	GO:0005385 (zinc ion transmembrane transporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0071577 (zinc ion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012914

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057796869.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057796869.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057796870.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057796870.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8179796`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8179796`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8179959`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8179999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8180105`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr2:8180105`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	D10
`Chr2:8180176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8180405`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A20,A3,B103,B106,B139,B15,B47,B80,C13,C20,C60,C61,D7
`Chr2:8180415`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57
`Chr2:8180961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B27,B57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940886.1
ACTTGTGTTTGAAAATTTGACGAGTTGAGTTGCGTATTTGGGGGAGATGGGTTTAATGGATTTGCAGGTTTTAGTTGCGCTTGCACTTTCCCTTCTGGGTGGTTTGAGTACCTCTATTGGAGCACTTTTTGTTGTCCTTAGTGAGACTCCAAATCTGAAGACACTTGGGCTCTTACAGGGTTTTGCTGCTGGGCTGATGCTGAGCATATCTTTCTTAGACTTGGCTCATAATGCCATTAATTCCATTGGCTTCTTAAAGG...

XM_057940887.1
ACTTGTGTTTGAAAATTTGACGAGTTGAGTTGCGTATTTGGGGGAGATGGGTTTAATGGATTTGCAGGTTTTAGTTGCGCTTGCACTTTCCCTTCTGGGTGGTTTGAGTACCTCTATTGGAGCACTTTTTGTTGTCCTTAGTGAGACTCCAAATCTGAAGACACTTGGGCTCTTACAGGGTTTTGCTGCTGGGCTGATGCTGAGCATATCTTTCTTAGACTTGGCTCATAATGCCATTAATTCCATTGGCTTCTTAAAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012914
ATGGGTTTAATGGATTTGCAGGTTTTAGTTGCGCTTGCACTTTCCCTTCTGGGTGGTTTGAGTACCTCTATTGGAGCACTTTTTGTTGTCCTTAGTGAGACTCCAAATCTGAAGACACTTGGGCTCTTACAGGGTTTTGCTGCTGGGCTGATGCTGAGCATATCTTTCTTAGACTTGGCTCATAATGCCATTAATTCCATTGGCTTCTTAAAGGGAAATCTATGGTTCTTTGCAGGTGTAATTTTCTTTGAGGTGATTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796869.1
MGLMDLQVLVALALSLLGGLSTSIGALFVVLSETPNLKTLGLLQGFAAGLMLSISFLDLAHNAINSIGFLKGNLWFFAGVIFFEVIANFIPEPNLAPISNVEKNKKNGDERNKDIMKKHRRQVLFSGIITAVGISLLTS

XP_057796870.1
MGLMDLQVLVALALSLLGGLSTSIGALFVVLSETPNLKTLGLLQGFAAGLMLSISFLDLAHNAINSIGFLKGNLWV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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