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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G000605`

染色体: Chr02 坐标: 8811418-8819629 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G000605`
名称	SmilChr02G000605
描述	uncharacterized SmilChr02G000605
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	8811418 - 8819629 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012936`
GeneID	`131012936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012936`
原始查询	`LOC131012936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OJ1595_D08.14-1; symbol=OJ1595_D08.14-1; hit=Os09g0469900; species=rice; confidence=high
产物	OJ1595_D08.14-1; symbol=OJ1595_D08.14-1; hit=Os09g0469900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os09g0469900` (OJ1595_D08.14-1) - identity=86.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0008479 (tRNA-guanosine(34) queuine transglycosylase activity); GO:0101030 (GO:0101030)
KEGG	-
Pfam	PF01702 (TGT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057796890.1`
2	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796891.1`
3	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057796891.1`
4	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057796891.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796890.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:8813181`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B65,C82
`Chr2:8814510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:8816909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B65
`Chr2:8817346`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B92
`Chr2:8817504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B9,B93
`Chr2:8817999`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	73	A13,A14,A15,A4,A6,A8,A9,B10,B105,B107,B108,B114,B118,B119,B123,B129,B132,B133,B134,B136,B18,B19,B2,B20,B25,B28,B36,B41,B47,B55,B6,B60,B61,B63,B64,B69,B75,B78,B79,B8,B80,B83,B86,B87,B90,C12,C13,C17,C21,C23,C28,C3,C30,C35,C37,C39,C4,C41,C42,C46,C50,C52,C6,C65,C67,C74,C75,C79,C81,C84,C85,D1,D9
`Chr2:8818027`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B111,B33,B46,B95,C14,C60,C72,C85
`Chr2:8818090`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	A11,B135,B28,B91
`Chr2:8818090`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A11,B135,B28,B91
`Chr2:8818177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C30
`Chr2:8818196`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A8,A9,B108,B114,B41,B78,B92,C35
`Chr2:8819082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796890.1

444 aa

222

444

TGT

PF01702 TGT 13-365 aa

XP_057796891.1

434 aa

217

434

TGT

PF01702 TGT 13-365 aa

XP_057796892.1

371 aa

186

371

TGT

PF01702 TGT 13-362 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796890.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	13	365	6.3e-152	506.5	Queuine tRNA-ribosyltransferase
`XP_057796891.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	13	365	4.1e-152	507.1	Queuine tRNA-ribosyltransferase
`XP_057796892.1`	Pfam	`PF01702`	TGT	Domain	13	362	5.7e-151	503.4	Queuine tRNA-ribosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940907.1
TTCCTATGTGAATTCCAAAAAAGAAAGGAAAAGTGAAAAATTAGTATAAAAAATGTCAACGAAAAACCCTAATTTATCTTCCAGCCGCTCTTAAGGCCTATCTTAAACCCCTATCCATCTTTCTTCTTCTCCACAGCTTAGAGGCTTACCCCACGACCGGCCGTTGACCGACAGAGCAGCCGCCGTTAATTCAACCGCTGCCTCCGTAACTGCACGACGCCAGCCTTCTGCTTTCTATCGTAACATCTGTTTAGCAAGAC...

XM_057940909.1
CTATGTGAATTCCAAAAAAGAAAGGAAAAGTGAAAAATTAGTATAAAAAATGTCAACGAAAAACCCTAATTTATCTTCCAGCCGCTCTTAAGGCCTATCTTAAACCCCTATCCATCTTTCTTCTTCTCCACAGCTTAGAGGCTTACCCCACGACCGGCCGTTGACCGACAGAGCAGCCGCCGTTAATTCAACCGCTGCCTCCGTAACTGCACGACGCCAGCCTTCTGCTTTCTATCGTAACATCTGTTTAGCAAGACAAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131012936
ATGGCTCTTCGTTTTGAGATTCTTGGGAAGTTCAATCGTGCTCGGGCGGCTCGACTTACACTTCCTCACTTTGTATGCCAGACGCCTCTATTTATGCCTGTGGGTACACAAGGTACAATAAAAGGTTTAACGACCAGTCAGCTTGAGGACATTGGATGCCAAATAATTCTTGGAAACACATATCACTTGGCTCTCCGTCCCACATCTGAGCTCATTGATGAGTTGGGAGGGCTCCATAAATTTATGAATTGGCCTAGGGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057796890.1
MALRFEILGKFNRARAARLTLPHFVCQTPLFMPVGTQGTIKGLTTSQLEDIGCQIILGNTYHLALRPTSELIDELGGLHKFMNWPRGLLTDSGGFQMVSLLHLADITEEGVTFQSPVDGKPMLLTPEESIQIQNRIGADIIMALDDVVKTTITGPRIEEAMYRTLRWIDRCIAAHKRPHDQNLFGIVQGGLDPVLRDICVKGLVDRKLPGYAIGGLAGGEDKDSFWRVVAQCTASLPENKPRYVMGVGYPLDIVVCSALG...

XP_057796891.1
MALRFEILGKFNRARAARLTLPHFVCQTPLFMPVGTQGTIKGLTTSQLEDIGCQIILGNTYHLALRPTSELIDELGGLHKFMNWPRGLLTDSGGFQMVSLLHLADITEEGVTFQSPVDGKPMLLTPEESIQIQNRIGADIIMALDDVVKTTITGPRIEEAMYRTLRWIDRCIAAHKRPHDQNLFGIVQGGLDPVLRDICVKGLVDRKLPGYAIGGLAGGEDKDSFWRVVAQCTASLPENKPRYVMGVGYPLDIVVCSALG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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