当前解析结果
SmilChr02G000612| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000612 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000612 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr02G000612 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 8936817 - 8943434 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131012942 |
|---|---|
| GeneID | 131012942 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012942 |
| 原始查询 | LOC131012942 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF02992 (Transposase_21); PF03004 (Transposase_24); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012942 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057796899.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057796899.1 |
| 3 | Telomere | 端粒 | 0.20000 | XP_057796899.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057796900.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057796900.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057796899.1PF02992
Transposase_21 156-368 aa
PF13960
DUF4218 552-665 aa
PF13952
DUF4216 834-907 aa
XP_057796900.1PF03004
Transposase_24 177-304 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057796899.1 |
Pfam | PF02992 |
Transposase_21 | Family | 156 | 368 | 5.2e-79 | 265.1 | Transposase family tnp2 |
XP_057796899.1 |
Pfam | PF13960 |
DUF4218 | Domain | 552 | 665 | 1.9e-40 | 138.0 | Domain of unknown function (DUF4218) |
XP_057796899.1 |
Pfam | PF13952 |
DUF4216 | Domain | 834 | 907 | 2.5e-17 | 63.9 | Domain of unknown function (DUF4216) |
XP_057796900.1 |
Pfam | PF03004 |
Transposase_24 | Family | 177 | 304 | 2.3e-13 | 51.2 | Plant transposase (Ptta/En/Spm family) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。