当前解析结果
SmilChr02G000626| 统一新 Gene ID | SmilChr02G000626 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr02G000626 |
| 描述 | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 |
| 染色体 / SeqID | Chr02 / NC_080388.1 |
| 坐标与链方向 | 9350353 - 9353653 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131012956 |
|---|---|
| GeneID | 131012956 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131012956 |
| 原始查询 | LOC131012956 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 |
| 产物 | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 |
| Arabidopsis | AT1G06550 (AT1G06550)ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837166] identity=56.5; qcov=0.489; evalue=3.44e-09; confidence=low |
| Rice | Os02g0229000- identity=67.7; qcov=0.362; evalue=1.42e-06; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF16113 (ECH_2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131012956 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057796928.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057796925.1 |
| 3 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057796925.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057796928.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057796928.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr2:9351070 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A8,C51,C65 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057796922.1PF16113
ECH_2 21-61 aa
XP_057796923.1PF16113
ECH_2 21-61 aa
XP_057796924.1PF16113
ECH_2 21-61 aa
XP_057796927.1PF16113
ECH_2 21-61 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057796922.1 |
Pfam | PF16113 |
ECH_2 | Domain | 21 | 61 | 5.5e-09 | 36.7 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
XP_057796923.1 |
Pfam | PF16113 |
ECH_2 | Domain | 21 | 61 | 5.5e-09 | 36.7 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
XP_057796924.1 |
Pfam | PF16113 |
ECH_2 | Domain | 21 | 61 | 5.5e-09 | 36.7 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
XP_057796927.1 |
Pfam | PF16113 |
ECH_2 | Domain | 21 | 61 | 4.5e-09 | 37.0 | Enoyl-CoA hydratase/isomerase |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
13 records
下载 cDNA FASTA7 records
下载 CDS FASTA7 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。