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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001272`

染色体: Chr02 坐标: 23280332-23282031 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001272`
名称	SmilChr02G001272
描述	uncharacterized SmilChr02G001272
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	23280332 - 23282031 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012964`
GeneID	`131012964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012964`
原始查询	`LOC131012964`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=29.7; qcov=0.932; evalue=2.13e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796932.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796932.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796932.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796932.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057796932.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:23280521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:23280567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B66
`Chr2:23280568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B129,B66
`Chr2:23280580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:23280586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr2:23280600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:23280632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C29
`Chr2:23280638`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B129,B30,C86,D1
`Chr2:23280711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B122,B30,B45,B98
`Chr2:23280721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B35,B75,C79
`Chr2:23280727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B35,B75,C79
`Chr2:23280745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B55,C56,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796933.1

148 aa

148

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 31-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796933.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	31	126	3.8e-06	28.5	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940949.1
GCTCATGGAGGCAACACAGACCTTGGCGCCAAGTTGAATAACGGAGAAGAAGAATCTGCAACGGGGCATTTGTCGCTACTTATCGGGGTAGGGATTTTGGGCACTTGTCGCTGCTTATCGGGGTAGGGATTTTTCGTCTGTTCGACACATCCATGGCAAGCAATGCGAGGCAACAAGATATGCAAGCAGGGAGCACCGAGGGTTGCCGAGGCAGGGTAAGTAAGACGGACAAGACCCGTCGTAGCTGGTCGACAAGGGAA...

XM_057940950.1
GCTCATGGAGGCAACACAGACCTTGGCGCCAAGTTGAATAACGGAGAAGAAGAATCTGCAACGGGGCATTTGTCGCTACTTATCGGGGTAGGGATTTTGGGCACTTGTCGCTGCTTATCGGGGTAGGGATTTTTCGTCTGTTCGACACATCCATGGCAAGCAATGCGAGGCAACAAGATATGCAAGCAGGGAGCACCGAGGGTTGCCGAGGCAGGGTAAGTAAGACGGACAAGACCCGTCGTAGCTGGTCGACAAGGGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131012964
ATGGAAGCTGTTCATGACATGTACACTGCTGAAAACATTGCGCAGGAGGACCGTGGGGCATATTTCAATTCAGCTGATGAGGAGGTTCCAACCGACGAGGCAGAGGTAAGTGTTTGCCAGACTGAGAAAAAATGCAACAGAGGAGGTGGTTCCAAGAAGAAACGCAAGTCGCCTGATGAGTTTGATAGATTGTGTGATGTGCTTGGTGAAATTGGTCACGACACTGGACTGAGGCTCGGGGACCTTGTAACTCGCATCGG...

LOC131012964
ATGGCAAGCAATGCGAGGCAACAAGATATGCAAGCAGGGAGCACCGAGGGTTGCCGAGGCAGGGTAAGTAAGACGGACAAGACCCGTCGTAGCTGGTCGACAAGGGAAGAGGAGATATTGCTGGCATCGTTGAAGGAAATCGTTGCTCAAGGCTGGAAGGCAGACAATGGCTTTAGGGGCGGCTATCTGACCAAGCTTGAGGAGTCAATCCGTAAGGAATTTCCAGATACTGACATCAAAGGCATGCCCCACATTAACTC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057796932.1
MEAVHDMYTAENIAQEDRGAYFNSADEEVPTDEAEVSVCQTEKKCNRGGGSKKKRKSPDEFDRLCDVLGEIGHDTGLRLGDLVTRIGYEFDLGQARQTIFEKLGAISGLSTKEKFEVCEMLADKVQRLEIFIGLSEDAKAQYVAYLLESKLN

XP_057796933.1
MASNARQQDMQAGSTEGCRGRVSKTDKTRRSWSTREEEILLASLKEIVAQGWKADNGFRGGYLTKLEESIRKEFPDTDIKGMPHINSKISAWKKSYNSLLGMLDVSGVGFNHKGTFMIDCDNDQWELIVKKDKNALNMRFKSWPMLDD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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