Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004231`

染色体: Chr02 坐标: 64501118-64502452 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004231`
名称	SmilChr02G004231
描述	uncharacterized SmilChr02G004231
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64501118 - 64502452 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012975`
GeneID	`131012975`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012975`
原始查询	`LOC131012975`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0667000; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0667000; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G76065` (AT1G76065) LYR family of Fe/S cluster biosis protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007850] identity=63.3; qcov=0.975; evalue=1.7e-31; confidence=medium
Rice	`Os02g0667000` - identity=63.8; qcov=0.988; evalue=1.67e-31; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion)
KEGG	-
Pfam	PF05347 (Complex1_LYR); PF13233 (Complex1_LYR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012975

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057796947.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	1.00000	`XP_057796947.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.20000	`XP_057796947.1`
4	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.20000	`XP_057796947.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796947.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796947.1

81 aa

Complex1_LYR

Complex1_LYR_2

PF05347 Complex1_LYR 15-70 aa PF13233 Complex1_LYR_2 16-73 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796947.1`	Pfam	`PF05347`	Complex1_LYR	Family	15	70	1.6e-16	60.7	Complex 1 protein (LYR family)
`XP_057796947.1`	Pfam	`PF13233`	Complex1_LYR_2	Family	16	73	5.3e-06	27.8	Complex1_LYR-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940964.1
CACCAAAATAAATGTTTTGAATGGGCTGGAGCAAGTACGCTAGCCCAGTGGTTCAGAAGTAAATGTTTTGAAGTTAGAGAGAGAGAGAGGAGGAGGAAGATGGTTGTAGCGTTGGATTTGCAGGATTTCCTTCTGCGAGCTAGGGTTCTTAAGCTTTACAGACATGCTCTCAGGATTTCGAGGAGAGCCCCGCCTGATTCTAAAGATGAAGTGAGACAGATTATCAGACAAGAGGTGGAAAACAACAGGACTTGCAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012975
ATGGTTGTAGCGTTGGATTTGCAGGATTTCCTTCTGCGAGCTAGGGTTCTTAAGCTTTACAGACATGCTCTCAGGATTTCGAGGAGAGCCCCGCCTGATTCTAAAGATGAAGTGAGACAGATTATCAGACAAGAGGTGGAAAACAACAGGACTTGCAAAGACAAACAGAGGATTAAGTTTTTGATCAGTGATGGACAGGAGAGGTTGAAGCGGTTAGATGAGACGCTCGATATGCAAGGACGTTAA

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796947.1
MVVALDLQDFLLRARVLKLYRHALRISRRAPPDSKDEVRQIIRQEVENNRTCKDKQRIKFLISDGQERLKRLDETLDMQGR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器