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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004233`

染色体: Chr02 坐标: 64511125-64512545 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004233`
名称	SmilChr02G004233
描述	thioredoxin-like protein CDSP32, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64511125 - 64512545 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012977`
GeneID	`131012977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012977`
原始查询	`LOC131012977`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin-like protein CDSP32, chloroplastic
产物	thioredoxin-like protein CDSP32%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G76080` (CDSP32) chloroplastic drought-induced stress protein of 32 kD [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843940] identity=67.7; qcov=1.03; evalue=7.44e-145; confidence=high
Rice	`Os07g0476900` (CDSP32) - identity=78.8; qcov=0.783; evalue=2.83e-135; confidence=high
GO	GO:0016671 (oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057796949.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057796949.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796949.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796949.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796949.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64511407`	`AAT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	136	A10,A11,A13,A14,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A24,A7,A8,A9,B10,B101,B104,B105,B107,B108,B109,B11,B110,B115,B117,B12,B120,B128,B132,B133,B136,B14,B140,B18,B19,B2,B21,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B3,B31,B35,B37,B38,B4,B40,B42,B43,B44,B46,B49,B50,B51,B52,B55,B58,B59,B63,B67,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B84,B86,B9,B91,B99,C1,C10,C13,C18,C20,C21,C23,C24,C26,C29,C3,C30,C33,C35,C37,C39,C4,C40,C41,C43,C45,C49,C5,C53,C56,C57,C58,C59,C60,C61,C62,C64,C66,C70,C71,C73,C76,C77,C79,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D1,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8,D9
`Chr2:64511427`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B78
`Chr2:64511427`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B78
`Chr2:64511520`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:64511685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:64511802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B135
`Chr2:64512030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:64512129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:64512156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B77,C49,C71
`Chr2:64512168`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B77,C49,C71
`Chr2:64512179`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796949.1

295 aa

148

295

Thioredoxin

PF00085 Thioredoxin 71-158 aa PF00085 Thioredoxin 200-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796949.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	71	158	6.6e-19	68.5	Thioredoxin
`XP_057796949.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	200	280	6.6e-19	68.5	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940966.1
AAATAGTGAAAATATAAGATGTTTGTAAGTTAGGTATATATTTGAAAATTCATAATAAAAACAAAGTATTAAAAAAAATCTATCCTAGATATGCAGAGAGAATATGTGGATAACATAAGTTATCCACCCACAACCACATGGATAAAATAATCTAACCTGTCCTCAATAATTTCCATCTCTCTCTGCGTCTCTCAACAACGTCAATCTTCTCCCCAACGCCAAAATCTTGAATAACTCTACAATCAATCCATGGCTTCCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012977
ATGGCTTCCATGGCTGCTACATTCACAAACTTCTTAGCCAAACAAACCCCATACCTGAGTCCTGTGAGCAAAACAACTCTTCAATTCTCCACCAATCACCTCCCAACAAAAGATCACCTGATGTGCAAGCTCCAGACGGGCCGCAGCGTGAAATCGGCGGCGGCCGCGACGGGCGTGGAGAAGGTGAGCCGCGACGAGAGGGTCCAGAAGGTCCACAGCATGGCGGAGTTCGACGAGGCCCTGCGCAAGGCGAAGAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796949.1
MASMAATFTNFLAKQTPYLSPVSKTTLQFSTNHLPTKDHLMCKLQTGRSVKSAAAATGVEKVSRDERVQKVHSMAEFDEALRKAKNRLVVVEYAASDSENSNQIYPFMVELSRSCSDVDFLLVMGDESEATRALCAREKIEQVPHFSFYKSMEKIHEEEAIGPDQLVGDVLYYGDSHSAVVQLHSREDVEKLIGDHKADGKLIVLDVGLKHCGPCVKVYPTVIKLSRSMEDTVIFARMNGDENDSCMQFLRDMDVVEVPT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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