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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004237`

染色体: Chr02 坐标: 64552776-64556602 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004237`
名称	SmilChr02G004237
描述	phospholipase D delta-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64552776 - 64556602 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012981`
GeneID	`131012981`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012981`
原始查询	`LOC131012981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phospholipase D delta-like
产物	phospholipase D delta-like
Arabidopsis	`AT4G35790` (PLDDELTA) phospholipase D delta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829733] identity=63; qcov=0.968; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0543100` (OsPLDdelta1) - identity=66.3; qcov=0.942; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004630 (D-type glycerophospholipase activity); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0009395 (phospholipid catabolic process); GO:0046470 (phosphatidylcholine metabolic process)
KEGG	smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00565 (Ether lipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00168 (C2); PF00614 (PLDc); PF13091 (PLDc_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012981

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796954.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057796954.1`
3	Endosome	内体	0.60000	`XP_057796954.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796954.1`
5	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057796954.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64552828`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	64	A1,A11,A13,A15,B102,B103,B104,B106,B109,B11,B111,B115,B117,B124,B125,B127,B128,B129,B140,B16,B17,B19,B20,B23,B30,B34,B42,B43,B47,B49,B5,B52,B53,B54,B60,B61,B62,B64,B66,B70,B72,B75,B86,B90,B92,B99,C1,C13,C21,C27,C28,C3,C31,C38,C42,C43,C44,C45,C50,C53,C55,C65,C73,D11
`Chr2:64553074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C78
`Chr2:64553552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B95,C11,C47,C69
`Chr2:64553728`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A9,D7
`Chr2:64554796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr2:64554882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr2:64555410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B42,B43
`Chr2:64555887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C54,D7
`Chr2:64556159`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C32
`Chr2:64556185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr2:64556353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B23,B49,B52,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796954.1

896 aa

448

896

PLDc

PLDc_2

PF00168 C2 66-197 aa PF00614 PLDc 285-885 aa PF13091 PLDc_2 727-779 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796954.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	66	197	4.8e-19	69.2	C2 domain
`XP_057796954.1`	Pfam	`PF00614`	PLDc	Domain	285	885	1.1e-216	721.3	Phospholipase D
`XP_057796954.1`	Pfam	`PF13091`	PLDc_2	Domain	727	779	5.3e-10	39.9	Cardiolipin synthase, PLD-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940971.1
AAATATAAAGGCAGGCCCGTAAGTAAAATGACCCCCTCCTTGTCGTACGTAGAAAATTCCTTTCCGCCACACATATTCTTTGATCTGGAGCACCATATCGGCGACGGCGGAGACACGAGACAAGCAGCATTCTCCGCCACGGCGCAGTCAGATAAGAATATTGTCTCAGACGAAATGGGCGAAGAAACCCCTGGAAACGACATAATATACCTCCATGGCGACCTGGACCTGAAGATCATCGAAGCCCGGTGCCTCCCCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012981
ATGACCCCCTCCTTGTCGTACGTAGAAAATTCCTTTCCGCCACACATATTCTTTGATCTGGAGCACCATATCGGCGACGGCGGAGACACGAGACAAGCAGCATTCTCCGCCACGGCGCAGTCAGATAAGAATATTGTCTCAGACGAAATGGGCGAAGAAACCCCTGGAAACGACATAATATACCTCCATGGCGACCTGGACCTGAAGATCATCGAAGCCCGGTGCCTCCCCAATATGGACCTCCTGGTGGAGCGCCTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796954.1
MTPSLSYVENSFPPHIFFDLEHHIGDGGDTRQAAFSATAQSDKNIVSDEMGEETPGNDIIYLHGDLDLKIIEARCLPNMDLLVERLRRFLTAFKTFQKPLTPHCRRRRHKQHSKIITSDPYVTVCLAGARVARTRVISNSQNPAWNEHFKIPLAHPVSQIEFEVKDNDVFGADRIGVATVAASRIASGETIDEWIPLIGPQGRPYKPDTAVRLEITFTPCSENPAYRQGVTEKYALRESYFPLRHGGKVTLYQDAHVPDG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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