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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004244`

染色体: Chr02 坐标: 64638175-64643463 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004244`
名称	SmilChr02G004244
描述	mechanosensitive ion channel protein 8-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	64638175 - 64643463 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131012985`
GeneID	`131012985`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131012985`
原始查询	`LOC131012985`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mechanosensitive ion channel protein 8-like
产物	mechanosensitive ion channel protein 8-like
Arabidopsis	`AT2G17010` (AT2G17010) Mechanosensitive ion channel family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816204] identity=56.4; qcov=0.877; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0668000` (OJ1725_H08.12-1) - identity=56.5; qcov=0.91; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006820 (monoatomic anion transport); GO:0008381 (mechanosensitive monoatomic ion channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00924 (MS_channel_2nd)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131012985

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057796959.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057796959.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796959.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796959.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057796959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:64638678`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	A8
`Chr2:64638678`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	A8
`Chr2:64639016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B36,B46
`Chr2:64639080`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:64639130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,C45
`Chr2:64639400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:64639407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B36,B46
`Chr2:64639589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:64639592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:64639802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C39
`Chr2:64639847`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B140
`Chr2:64639900`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A13,B100,B104,B105,B109,B125,B51,B77,C24,C3,C81,D10,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796959.1

851 aa

426

851

MS_channel_2nd

PF00924 MS_channel_2nd 668-725 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796959.1`	Pfam	`PF00924`	MS_channel_2nd	Domain	668	725	3.7e-12	46.9	Mechanosensitive ion channel, beta-domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057940976.1
CCACATATCTGTCACTACCTTGAAAAGGAAAGATATAATAAATTATTTTATTCGTTGCCAATTATTAGCAAAACTTTGTTATGTTAATTTTTTAAAATATGCAAGAATATGATATAAAATAATTTATGGGAATATAATGGTGGGATCACACAAAATAGTTTATAAATGGAAAGAGAGAGTACATGAAAAAAAAAAACAGTAGCGTACTGCGCCTAAACCTCCCCACCCGCCGTCGATTCGCCCCAATCTGTGCGGCGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131012985
ATGGAAACTCTCCATAGATCAAACAAGTCTTTACAGCCACAGCGAGAAGAAGAGCGCCAGATTCTCTTATCGGAGATGCCTTCCGCCGCCGCCGCCGCTGCGACCAAGACGCCTTCTTCCTCCTCCTCCACTCCATCTCCGCCCAAGGACGCCGAAATTAAAATCAACGGAGAAACGGTTAGTGTGAGTAGTAGCAGCAATGACGCTTCCGGAACTAACAGAATGTGGAGGGATTCCAGCTACGATTTCTCAAAGGACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796959.1
METLHRSNKSLQPQREEERQILLSEMPSAAAAAATKTPSSSSSTPSPPKDAEIKINGETVSVSSSSNDASGTNRMWRDSSYDFSKDAVMRPATSSKEFDFATESPASQQSPLSRIPESPAANNTYGQLTPREIRVSFNETVGNRRSNAEEERDEVLLCSSNNSFRRKSSFVRSKTKSRLLDQPEEFPTRSQTPRAPPKSQFLGKGTASEIDEDDPFLEEDLPEDYRSFKFSIVSILQLLSLIIIVAALACSLAIDVLKRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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