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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004290`

染色体: Chr02 坐标: 65223581-65224762 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004290`
名称	SmilChr02G004290
描述	uncharacterized SmilChr02G004290
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65223581 - 65224762 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013007`
GeneID	`131013007`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013007`
原始查询	`LOC131013007`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF241 domain protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843957]; symbol=AT1G76240; hit=AT1G76240; species=arabidopsis; confidence=high
产物	DUF241 domain protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843957]; symbol=AT1G76240; hit=AT1G76240; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G76240` (AT1G76240) DUF241 domain protein (DUF241) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843957] identity=45.7; qcov=1.03; evalue=7.92e-75; confidence=high
Rice	`Os06g0725500` - identity=29.4; qcov=1; evalue=1.18e-23; confidence=low
GO	GO:0048364 (root development); GO:0048367 (shoot system development)
KEGG	-
Pfam	PF03087 (BPS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013007

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057796992.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057796992.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057796992.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057796992.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057796992.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65223782`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C56,C65
`Chr2:65223821`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B125,B132,B17,B90,B92
`Chr2:65223821`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B125,B132,B17,B90,B92
`Chr2:65223912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C16
`Chr2:65223951`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B105,B123,B134,C9
`Chr2:65223953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:65224267`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C18
`Chr2:65224569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B8
`Chr2:65224590`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr2:65224663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057796992.1

303 aa

152

303

BPS1

PF03087 BPS1 72-300 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057796992.1`	Pfam	`PF03087`	BPS1	Family	72	300	5.1e-46	158.1	Protein BPS1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941009.1
CATAAATACACACCACACCACTCCATTCCTCAAACCAACATCTCCCTTTTCTCCATACCAAAACTAAAAAAAAAAAAAATATGGCACCGAAAATGGTGACCAGTTTTCGGCGCTCCCTTTCCTTCCCGAACCCGCCGTCCTCACACAATGCATCTAAACCCCGGAATGCCCTCCACGTGAGATCCACCAGTCTCCCGTGCCGCTCGCACCCCATTATTTCCCAGCTCCAAGACGAGATCTCCGAGCTGCACTCCTGGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013007
ATGGCACCGAAAATGGTGACCAGTTTTCGGCGCTCCCTTTCCTTCCCGAACCCGCCGTCCTCACACAATGCATCTAAACCCCGGAATGCCCTCCACGTGAGATCCACCAGTCTCCCGTGCCGCTCGCACCCCATTATTTCCCAGCTCCAAGACGAGATCTCCGAGCTGCACTCCTGGTCCGCCGCCTCCCGCACCTCCGCCTGGCTCTGCGACGGCCTCCGCCGCCTCAAGTCCGTCCACGAGTCCCTCGATGATCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057796992.1
MAPKMVTSFRRSLSFPNPPSSHNASKPRNALHVRSTSLPCRSHPIISQLQDEISELHSWSAASRTSAWLCDGLRRLKSVHESLDDLLHLPQTRDSLRGGDYSNLIDKLLEDFLRFVDVYGTFQTLLLRLKEEHSASQIAVRRKDNAGVAAHSKNLNKIAKDIKKLSSNFVSVGKSAAAAAPARAPYDEEAELVDVIHGVVEATVTVSNALFGGISSSAAFRKPSCMGLSFGRKTKNVKVEGGIREFQELNLENLRKKAEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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