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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005799`

染色体: Chr01 坐标: 74065083-74068284 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005799`
名称	SmilChr01G005799
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	74065083 - 74068284 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013043`
GeneID	`131013043`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013043`
原始查询	`LOC131013043`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
产物	putative late blight resistance protein homolog R1A-10
Arabidopsis	`AT3G46530` (RPP13) NB-ARC domain-containing disease resistance protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823806] identity=25.9; qcov=0.747; evalue=2.03e-36; confidence=low
Rice	`Os07g0186500` - identity=25.7; qcov=0.856; evalue=1.42e-40; confidence=low
GO	GO:0043531 (ADP binding); GO:0098542 (defense response to other organism)
KEGG	-
Pfam	PF00931 (NB-ARC); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013043

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057797024.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797024.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797024.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797024.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797024.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:74065169`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A5,B101,B121,B131,B139,B2,B20,B57,B67,B71,B82,B85,C56,C6,C65,C75,C81,C83
`Chr1:74065172`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A5,B101,B121,B131,B139,B2,B20,B57,B67,B71,B82,B85,C56,C6,C65,C75,C81,C83
`Chr1:74065173`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A10,A20,A22,B119,B120,B125,B135,B137,B16,B21,B28,B4,B52,B54,B6,B90,C22,C82
`Chr1:74065212`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:74065221`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D11
`Chr1:74065221`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D11
`Chr1:74065223`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	19	A10,A20,A22,B119,B120,B125,B135,B137,B16,B21,B28,B37,B4,B52,B54,B6,B90,C22,C82
`Chr1:74065225`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A10,A20,A22,B119,B120,B125,B135,B137,B16,B21,B28,B37,B4,B52,B54,B6,B90,C22,C82
`Chr1:74065314`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B36,C55
`Chr1:74065441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:74065446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,C54
`Chr1:74065466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797024.1

945 aa

472

945

NB-ARC

LRR_14

PF00931 NB-ARC 224-380 aa PF23598 LRR_14 632-886 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797024.1`	Pfam	`PF00931`	NB-ARC	Domain	224	380	1.1e-26	94.1	NB-ARC domain
`XP_057797024.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	632	886	1.8e-11	44.1	Leucine-rich repeat region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941041.1
ATGACGGCATATGGTGCAGCAAATTCTGTGGGGAATACAATTGATTATATTCTCCATTCCTCTCATTTTAGCCTCATTGGTCTCGATCGAGATACCTTACAAATCTTACAAATCGCTAACGATCAGTTGGAGTACCTACAAAACGTTCTGGAAAGATTGGACAGGACAAGCAAAAGCAAGAGCAGGAAGAAGGTGAATGGTTTGGATGGAAGAATCAAAGAGATGATTTGGGAATTCCAAGACTTATTGGAAACTCTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013043
ATGACGGCATATGGTGCAGCAAATTCTGTGGGGAATACAATTGATTATATTCTCCATTCCTCTCATTTTAGCCTCATTGGTCTCGATCGAGATACCTTACAAATCTTACAAATCGCTAACGATCAGTTGGAGTACCTACAAAACGTTCTGGAAAGATTGGACAGGACAAGCAAAAGCAAGAGCAGGAAGAAGGTGAATGGTTTGGATGGAAGAATCAAAGAGATGATTTGGGAATTCCAAGACTTATTGGAAACTCTTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797024.1
MTAYGAANSVGNTIDYILHSSHFSLIGLDRDTLQILQIANDQLEYLQNVLERLDRTSKSKSRKKVNGLDGRIKEMIWEFQDLLETLLYQQILPQLRADHLYEEMKDRARGEPPEKQAITASVWSSTEPRSKPVEVGLLTSGLSQPQFLSEVGLRESDSHERFSIDLKSLQRHVPSFSSRLEDMAKEYSYEVYNMPEDDDDVDESISSRSGTKSKMVGLSDQFQHLKREFMGSDGSYNYIALLGTAGVGKTALAEALFEDP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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