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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004348`

染色体: Chr02 坐标: 65748711-65757383 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004348`
名称	SmilChr02G004348
描述	uncharacterized SmilChr02G004348
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65748711 - 65757383 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013096`
GeneID	`131013096`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013096`
原始查询	`LOC131013096`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GPI-anchored adhesin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007999]; symbol=AT3G14172; hit=AT3G14172; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	GPI-anchored adhesin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007999]; symbol=AT3G14172; hit=AT3G14172; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G14172` (AT3G14172) GPI-anchored adhesin-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5007999] identity=42.2; qcov=0.514; evalue=6.07e-130; confidence=medium
Rice	`Os07g0616000` (EP2) - identity=44.1; qcov=0.334; evalue=3.12e-79; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30468 (CIP7_M); PF30469 (CIP7_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013096

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057797084.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797084.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057797084.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057797084.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65750105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B86
`Chr2:65751448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:65751449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr2:65751848`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B12,B86,D11
`Chr2:65751885`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C1
`Chr2:65752520`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B131,B95,C14
`Chr2:65752520`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B131,B95,C14
`Chr2:65752522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:65752546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr2:65752574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,C54
`Chr2:65752619`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B86
`Chr2:65752784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797084.1

1400 aa

700

1400

CIP7_N

CIP7_M

PF30469 CIP7_N 12-67 aa PF30468 CIP7_M 130-205 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797084.1`	Pfam	`PF30469`	CIP7_N	Domain	12	67	4.4e-26	91.6	CIP7 N-terminal domain
`XP_057797084.1`	Pfam	`PF30468`	CIP7_M	Domain	130	205	8.2e-17	62.3	CIP7 middle helical domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941101.1
AATCATCAGAGACTGTCTCCTTTGTCTTTCATTCGCAGTTAAAAAACATTTCTACAAATAACAAAAAGTCCAGCAAAAATAGAGTAATTTATATTTTTTCAGAAAAAAAGAAGATAAAGAATTTTGATTTTTATTGTTTGAAATCACATACTGTAACAGCATCGAACGCCATTTCCATTCTTCTTCTGCACTCCACCCTCTCTCTCTCTCCCTCTAAACACAGTTTTCTACGTCTCGCCGTACGTATATTTAGAGAGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013096
ATGGCAAAGCTGAAGTCAGATGCGCCTCTTGATTATGCTGTATTTCAGCTTTCTCCGAAGCGCTCACGATGCGAATTGTTTGTTTCGAGTGATGGGAGCACAGAGAAACTAGCCTCAGGATTGCTTAAACCATTCGTTTCACATTTACAGATTGCAGAGGAACAAGTTGCCTCTGCTGCACAGTCGGTTAAGCTTGAAGCTAGTCGCCATAAGAATGCTGAAGCGTGGTTCACCAAGGGTACACTAGAGAGGTTTGTAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797084.1
MAKLKSDAPLDYAVFQLSPKRSRCELFVSSDGSTEKLASGLLKPFVSHLQIAEEQVASAAQSVKLEASRHKNAEAWFTKGTLERFVRFVSTPEVLELVNTLDAEMSQLEAARRIYSQGAGDQLSGGGGSGATSGDDATKKELLRAIDVRLVAARQDLSNACARAAAAGFNIHTVSELHNFADSFGAHRLNEACGKFKSLNERRPELTHPWRSVSDDRASYGSDMSIDDDDDDAPPSPPPRRERADLPTRRAFSRESSVES...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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