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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004351`

染色体: Chr02 坐标: 65764145-65776001 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004351`
名称	SmilChr02G004351
描述	nuclear pore complex protein NUP107
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65764145 - 65776001 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013098`
GeneID	`131013098`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013098`
原始查询	`LOC131013098`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP107
产物	nuclear pore complex protein NUP107
Arabidopsis	`AT3G14120` (AT3G14120) nuclear pore complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820629] identity=65.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0643700` - identity=60; qcov=0.438; evalue=0; confidence=low
GO	GO:0000973 (post-transcriptional tethering of RNA polymerase II gene DNA at nuclear periphery); GO:0005643 (nuclear pore); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0006406 (mRNA export from nucleus); GO:0006606 (protein import into nucleus); GO:0017056 (structural constituent of nuclear pore); GO:0031080 (nuclear pore outer ring)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04121 (Nup84_Nup100)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013098

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797091.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057797091.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057797091.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797091.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797091.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65764845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:65766828`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:65767589`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr2:65768296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr2:65769501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:65770721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B125,B21,B52,C45
`Chr2:65770722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B125,B21,B52,C45
`Chr2:65770932`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr2:65775206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797091.1

1066 aa

533

1066

Nup84_Nup100

PF04121 Nup84_Nup100 182-854 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797091.1`	Pfam	`PF04121`	Nup84_Nup100	Repeat	182	854	9.7e-67	226.4	Nuclear pore protein 84 / 107

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941108.1
CACGAAATTCTTTAAAAAATAGTCACTCTAAGTCCACCGGAATCAAAAAACCCTTCCCGCCTGTAAAACCCTAATTAACCTCAATCATCCTCAGAAAATCGTCATTTTCAGCTAGTTTCTCTAGCTATGGAGGTGGATATGGATGCTTCTCCCAGCTATTTCGACCCAGAGAACCTTAGCAGTAGAGAGCGTTTCCGTCGATACGGGAAAAGACATCCAGGCTCTAGCCTGTCCCCTCATCATGATAATTCGGCTTCAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013098
ATGGAGGTGGATATGGATGCTTCTCCCAGCTATTTCGACCCAGAGAACCTTAGCAGTAGAGAGCGTTTCCGTCGATACGGGAAAAGACATCCAGGCTCTAGCCTGTCCCCTCATCATGATAATTCGGCTTCAAGATTTACTAATGCTGCACTATTTCTTGAAAACATTAAACATGAGGTCGAGATGCATGAGACGGATTTTGGAGGAACACCTTTTGAATCTTCTGCTAAAAGGAGATCTTACCATGATGGTTATGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797091.1
MEVDMDASPSYFDPENLSSRERFRRYGKRHPGSSLSPHHDNSASRFTNAALFLENIKHEVEMHETDFGGTPFESSAKRRSYHDGYGVSAADGHTDMIRRRGSESLKVCKKEEDEHIESADTTFSLFASLLDSGLQGLMPIPDLILRFESSCRSVSESIRYGANERYRIIEDKLMRQKARFLLDEAASWSLLWYIYGKGNEELTNDLLLFPTTSHLEACQFVIEDYTAQLCLRIVQWLEGLASKALDLDNKVRGSHVGTYL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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