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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004360`

染色体: Chr02 坐标: 65880094-65881441 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004360`
名称	SmilChr02G004360
描述	protein DEEPER ROOTING 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65880094 - 65881441 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013106`
GeneID	`131013106`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013106`
原始查询	`LOC131013106`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DEEPER ROOTING 1-like
产物	protein DEEPER ROOTING 1-like
Arabidopsis	`AT1G72490` (AT1G72490) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843581] identity=38.3; qcov=0.928; evalue=2.8e-17; confidence=low
Rice	`Os09g0439800` (DRO1) - identity=36.8; qcov=0.77; evalue=2.22e-11; confidence=low
GO	GO:0009630 (gravitropism); GO:0040008 (regulation of growth)
KEGG	-
Pfam	PF28425 (LAZY_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013106

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797102.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797104.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797104.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65880325`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C74
`Chr2:65880325`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C74
`Chr2:65880604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr2:65880699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,B98,C31,C7
`Chr2:65880715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B35
`Chr2:65880749`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:65880755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B74,B96,C87
`Chr2:65880771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C49
`Chr2:65880771`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr2:65880780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B73
`Chr2:65881040`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A10,A20,A22,A4,B102,B106,B110,B125,B129,B133,B135,B17,B22,B3,B31,B46,B55,B58,B61,B64,B65,B67,B81,B90,B92,B97,B99,C15,C19,C20,C22,C23,C29,C31,C36,C37,C43,C5,C55,C6,C82,C85,D1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797102.1

163 aa

163

LAZY_C

PF28425 LAZY_C 54-142 aa

XP_057797103.1

152 aa

152

LAZY_C

PF28425 LAZY_C 44-152 aa

XP_057797104.1

152 aa

152

LAZY_C

PF28425 LAZY_C 44-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797102.1`	Pfam	`PF28425`	LAZY_C	Family	54	142	4.2e-31	109.3	LAZY/DRO1
`XP_057797103.1`	Pfam	`PF28425`	LAZY_C	Family	44	152	3.5e-31	109.6	LAZY/DRO1
`XP_057797104.1`	Pfam	`PF28425`	LAZY_C	Family	44	131	2.7e-31	109.9	LAZY/DRO1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941120.1
AAATGTGAATGATAAAATTTGGTACGTATAAAGATAGGAGAGTATAACACGGAATGAAATACAAGATGCAACATGCATATTTATCGTTACGCATAAAATCAAATAAAATAAGAATCCCCATACAAATGTGATTGTGTTTGTGTGTGTGTATATATATACCATGCATGTATATAAAGGAGAATATTGTGGGAAGTGTGGGTAACTACCTGAGATTGCACAACTGCATTCGTTGAGAGGAAAAAAAAATCTTTGATCAAGTT...

XM_057941119.1
AAATGTGAATGATAAAATTTGGTACGTATAAAGATAGGAGAGTATAACACGGAATGAAATACAAGATGCAACATGCATATTTATCGTTACGCATAAAATCAAATAAAATAAGAATCCCCATACAAATGTGATTGTGTTTGTGTGTGTGTATATATATACCATGCATGTATATAAAGGAGAATATTGTGGGAAGTGTGGGTAACTACCTGAGATTGCACAACTGCATTCGTTGAGAGGAAAAAAAAATCTTTGATCAAGTT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013106
ATGAAGTTATTGAGCTGGATGCAAAGCAAGTTGAGTGCAGGACATGGCCATCGGCTACTATCAATGGACTACAAAGATGAGATGCACAAACACGTTGAAGGAATTAGGTTGGATAGTGAGATTCCTGAATGTAATTTCTCATCAGCTGAGGAAAACGAATTGGGTCAAGACATTGATCGAACGATTCGGATTATTCTAGGAAGATGCAAACATGGCTGTCAGAATAAGACAGCAACGGGGAAGAAATCTTTGTCTTTTCT...

LOC131013106
ATGAAGTTATTGAGCTGGATGCAAAGCAAGTTGAGTGCAGGACATGGCCATCGAGATGAAAAGAATGAAGAAGCTCCTAATTATAGGCTACTATCAATGGACTACAAAGATGAGATGCACAAACACGTTGAAGGAATTAGGTTGGATAGTGAGATTCCTGAATGTAATTTCTCATCAGCTGAGGAAAACGAATTGGGTCAAGACATTGATCGAACGATTCGGATTATTCTAGGAAGATGCAAACATGGCTGTCAGAATAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797102.1
MKLLSWMQSKLSAGHGHRDEKNEEAPNYRLLSMDYKDEMHKHVEGIRLDSEIPECNFSSAEENELGQDIDRTIRIILGRCKHGCQNKTATGKKSLSFLVRKLFLRTTSTPTTFRDAFQESRMEKLMRAMLAKKIHPRNSSANQNAEHGFKWDKTDSEFIVLEI

XP_057797103.1
MKLLSWMQSKLSAGHGHRLLSMDYKDEMHKHVEGIRLDSEIPECNFSSAEENELGQDIDRTIRIILGRCKHGCQNKTATGKKSLSFLVRKLFLRTTSTPTTFRDAFQESRMEKLMRAMLAKKIHPRNSSANQNAEHGFKWDKTDSEFIVLEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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