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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004364`

染色体: Chr02 坐标: 65934582-65938264 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004364`
名称	SmilChr02G004364
描述	probable GTP diphosphokinase RSH2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	65934582 - 65938264 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013110`
GeneID	`131013110`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013110`
原始查询	`LOC131013110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable GTP diphosphokinase RSH2, chloroplastic
产物	probable GTP diphosphokinase RSH2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G54130` (RSH3) RELA/SPOT homolog 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841853] identity=64.2; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0457600` (RSH2) - identity=59; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0009507 (chloroplast); GO:0015969 (guanosine tetraphosphate metabolic process)
KEGG	smil00230 (Purine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01966 (HD); PF04607 (RelA_SpoT); PF13328 (HD_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013110

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797107.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057797107.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797107.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797107.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:65935185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B135,B55,C23
`Chr2:65935275`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C31
`Chr2:65935408`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr2:65935494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:65935668`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:65935945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B44,B94,C74
`Chr2:65935995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:65936020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A20,B135,B55,C23
`Chr2:65936651`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,C20
`Chr2:65937675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:65937861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr2:65937981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B30,B39,C1,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797107.1

711 aa

356

711

HD_4

RelA_SpoT

PF13328 HD_4 222-376 aa PF01966 HD 241-345 aa PF04607 RelA_SpoT 435-544 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797107.1`	Pfam	`PF13328`	HD_4	Family	222	376	3.2e-43	147.9	HD domain
`XP_057797107.1`	Pfam	`PF01966`	HD	Family	241	345	3.4e-08	34.5	HD domain
`XP_057797107.1`	Pfam	`PF04607`	RelA_SpoT	Family	435	544	1.8e-38	132.0	Region found in RelA / SpoT proteins

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941124.1
AAGTCGGACATCAAACTTTAATTCCTTAATAAAAGAAAAAAAGAGAAAAACAAACGCGTCCTAAATTTGCTGCGCTAAAATCCGTATGCCGTTATTTCAGGTAGAGTCTGAGGGCATTTCTGTATTCTCCGCCTTCCGTTGGCATAAATTCTCAACTATTTCAGAGAAGCAGAGAAAAAAAGAAAACAAGAATCGGAGGAGAGAAGGAGAAGAAATTCTGAAGAAGTCTCCATCACTTTCTCTCTCAAAAATTTCTTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013110
ATGACGGTGCCGACGATCGCTCTCTACGCGAGCCCTAGCAGCGTCTGTTCTGCGCCTCACCAGATCAATTCTCACGCGCCATACGATTTAGACGTGACCAGCCGGTCAACCTCGTCGTCGGCGGCGTCGCCGTCGCAAAGAGCGGTGACCGGGGGGTTATCCTGCCTGTTTTCGACGGCCCCGATCAAGTCGGCGAGTTATTCGACCGGGGGCGAGGAATTGGGGTCGCTGTGGCATGACAGAACGGAGGAGCTGGGGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797107.1
MTVPTIALYASPSSVCSAPHQINSHAPYDLDVTSRSTSSSAASPSQRAVTGGLSCLFSTAPIKSASYSTGGEELGSLWHDRTEELGSSYRYSSLSSSFKRDQAHQSPISVLQGPSSSIGLNSRSVPLRMNGEFNSIRSGSGCMFNGFVRHALGACVDYDSPPLGLDVVDSDSSSSSMLPTDDLTFNMEGSFVEFDLPSYAKDLLCEAQSRHSIFRDDFVIKAFDEAEKAHRGQKRASGHPYLQHCVETAMLLANIGANST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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