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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004375`

染色体: Chr02 坐标: 66114516-66116923 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004375`
名称	SmilChr02G004375
描述	protein ELF4-LIKE 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66114516 - 66116923 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013122`
GeneID	`131013122`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013122`
原始查询	`LOC131013122`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ELF4-LIKE 4-like
产物	protein ELF4-LIKE 4-like
Arabidopsis	`AT1G17455` (ELF4-L4) ELF4-like 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838318] identity=64.9; qcov=1; evalue=2.39e-43; confidence=medium
Rice	`Os11g0621500` (ELF4_chr.11) - identity=65.8; qcov=1.03; evalue=6.2e-46; confidence=medium
GO	GO:0009649 (entrainment of circadian clock); GO:0042753 (positive regulation of circadian rhythm)
KEGG	-
Pfam	PF07011 (Elf4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013122

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797121.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057797121.1`
3	Centromere	着丝粒	1.00000	`XP_057797121.1`
4	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057797121.1`
5	Spindle	Spindle	0.40000	`XP_057797121.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66115898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797121.1

114 aa

114

Elf4

PF07011 Elf4 16-92 aa

XP_057797122.1

114 aa

114

Elf4

PF07011 Elf4 16-92 aa

XP_057797123.1

114 aa

114

Elf4

PF07011 Elf4 16-92 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797121.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	92	2.9e-32	111.1	Early Flowering 4 domain
`XP_057797122.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	92	2.9e-32	111.1	Early Flowering 4 domain
`XP_057797123.1`	Pfam	`PF07011`	Elf4	Domain	16	92	2.9e-32	111.1	Early Flowering 4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941140.1
GCATTAACTATTGGAGGCAAGTGGAAGCTAACATGGGAGCTGGAGATTGGAGAATACTTTTCCATAATCATCGAAAAAGGCCAGCAATGAATGAAGGCCGAATCCCGCAGGTGAAGTAAGCGGAGAGAGAAAGTACATATCCATCTGTCAAAACTCTCTCTCTACAATTTTTAGACAGAGAAAGAAAAATCCCACAAAGCCACCATAGGACGAGGATCCTCCGTGTGACTGACTCTCTGTATTGTCGAATCCCGTACAAA...

XM_057941139.1
ATTAACTATTGGAGGCAAGTGGAAGCTAACATGGGAGCTGGAGATTGGAGAATACTTTTCCATAATCATCGAAAAAGGCCAGCAATGAATGAAGGCCGAATCCCGCAGGTGAAGTAAGCGGAGAGAGAAAGTACATATCCATCTGTCAAAACTCTCTCTCTACAATTTTTAGACAGAGAAAGAAAAATCCCACAAAGCCACCATAGGACGAGGATCCTCCGTGTGACTGACTCTCTGTATTGTCGAATCCCGTACAAAGC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013122
ATGGAAGACGATATATTTTCGAGCATTGCAGCTAGTGGACAGATTGAGCCTAAGTTTCAACAAAGATTTCAGAAAAACTTTGTGCTGGTCCAGAACATTTTGGACCAGAACAGGTTGTTGATAAATGAGATCAACCAGAACCACGAGTCGAAGATCCCAGACAAGTTGACGCGTAATGTGGGACTAATTCGTGAGCTCAACAACAACATTAGACGGGTGGTTGACCTATACAGCCATCTCTCCGACTCTGCCAGATCAAT...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797121.1
MEDDIFSSIAASGQIEPKFQQRFQKNFVLVQNILDQNRLLINEINQNHESKIPDKLTRNVGLIRELNNNIRRVVDLYSHLSDSARSMETLSEGESAGTTKSDGRGGLKRVRSGN

XP_057797122.1
MEDDIFSSIAASGQIEPKFQQRFQKNFVLVQNILDQNRLLINEINQNHESKIPDKLTRNVGLIRELNNNIRRVVDLYSHLSDSARSMETLSEGESAGTTKSDGRGGLKRVRSGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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