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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004382`

染色体: Chr02 坐标: 66170680-66179784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004382`
名称	SmilChr02G004382
描述	polyadenylate-binding protein-interacting protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66170680 - 66179784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013128`
GeneID	`131013128`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013128`
原始查询	`LOC131013128`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein-interacting protein 3-like
产物	polyadenylate-binding protein-interacting protein 3-like
Arabidopsis	`AT3G14010` (CID4) CTC-interacting domain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820615] identity=45.5; qcov=1.03; evalue=1.79e-141; confidence=high
Rice	`Os02g0480900` (P0519B12.23-1) - identity=43.6; qcov=1.02; evalue=2.5e-130; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0010494 (cytoplasmic stress granule); GO:0034063 (stress granule assembly)
KEGG	-
Pfam	PF06741 (LsmAD); PF14438 (SM-ATX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013128

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797139.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057797139.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057797139.1`
4	P-body	P-body	1.00000	`XP_057797139.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797139.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66172536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,C38,C39,C70
`Chr2:66172567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:66173811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B56,B96,C20
`Chr2:66174365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr2:66174979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B6
`Chr2:66176178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,B4,C71,C85
`Chr2:66176777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C5
`Chr2:66176975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B109,B11,C13
`Chr2:66177126`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797139.1

609 aa

304

609

SM-ATX

LsmAD

PF14438 SM-ATX 56-138 aa PF06741 LsmAD 214-284 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797139.1`	Pfam	`PF14438`	SM-ATX	Domain	56	138	3.5e-26	91.9	Ataxin 2 SM domain
`XP_057797139.1`	Pfam	`PF06741`	LsmAD	Domain	214	284	7.7e-25	87.9	LsmAD domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941156.1
TTGGCGATCATTAATTTGATTCAGCTCCTCAACTCTGATTCGGATCCGGCGAAGTAATCCCAATTCTCAGTTCGGAAACGACGCCTTGCCTTCTCCGATCTGACCCTACTTCTCAGATCGCATCTTCTCTTTCCCTCTCTCTCTTACCTATCTACTGGGTTGAGTCAGCTGCCTATTCTTGAGCTCATCTTTAAAGATGAATATGCAGCAAGTTGTGCAGCCCAGATCTTCTTCGAATGGATATGGTCGTCGTAAAGTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013128
ATGAATATGCAGCAAGTTGTGCAGCCCAGATCTTCTTCGAATGGATATGGTCGTCGTAAAGTTGAAAAAGATCATGCGGCTAGGTCTGACAGTAAATTTCAGACGGGGAAAGCAAATTATAGCAGGACTAATTTTGGTAAAGGAGGGGTACTTGAACCGCCTTCACGTGATCGATTGATATATTTAACTACATGCCTCATTGGACATCAAGTGGAAGTCCAGGTGATGGATGGATCTGTGTTTTCTGGAATATTTCATGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797139.1
MNMQQVVQPRSSSNGYGRRKVEKDHAARSDSKFQTGKANYSRTNFGKGGVLEPPSRDRLIYLTTCLIGHQVEVQVMDGSVFSGIFHATNADDFGIVLKMAHLIKDGSQGQKDVSDSISKPSSKTLIIPANDLIQVIAKGVPVTRDGLSNELQYERQQELLTDSCISQSRHVDVGRELERWIPDENDPSCPDLENIFDSPWKRGWDQFEANATLFGVKSTFNEELYTTKLEKGPQMRELEKEAMRIAREIEGEDTRDLHLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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