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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004391`

染色体: Chr02 坐标: 66257968-66258586 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004391`
名称	SmilChr02G004391
描述	uncharacterized SmilChr02G004391
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66257968 - 66258586 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013140`
GeneID	`131013140`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013140`
原始查询	`LOC131013140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070]; symbol=AT5G11970; hit=AT5G11970; species=arabidopsis; confidence=low
产物	ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070]; symbol=AT5G11970; hit=AT5G11970; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G11970` (AT5G11970) ABC family ABC transporter, putative (DUF3511) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831070] identity=47.4; qcov=1.04; evalue=3.95e-20; confidence=low
Rice	`Os03g0302500` - identity=55.1; qcov=0.445; evalue=5.91e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12023 (DUF3511)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013140

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057797157.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057797157.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797157.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797157.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797157.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66258353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B56,B96,C20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797157.1

110 aa

110

DUF3511

PF12023 DUF3511 66-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797157.1`	Pfam	`PF12023`	DUF3511	Family	66	108	1.9e-23	82.7	Domain of unknown function (DUF3511)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941174.1
CAAGAAACCAACACCTTCCCACCTCCTCAAAATTCCCCCAAAAAATAACAAACTCACAACTCAATCCCAAGAAAATTAGACCCTTCTCCCCTTCTCCTTGCTTTCCACTGTGTGCTGTGTGTGTGCTTTTCCCCCATATTCATCCATAGTCAAATTAAACCCTTCTTCTCTTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCACACACACACACACTTGATGGAGAAGTTCTCAAGATCCAAGTCTACAAGGGATGAGTATATGCAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013140
ATGGAGAAGTTCTCAAGATCCAAGTCTACAAGGGATGAGTATATGCAGCCAAGAAGCATGAATGATCTGAGAAGCTACAGCACCTCAGATTACAATCCACCTCATCACCATCAAAATCTTGATGAGAATTTCAAAGAGATGAAGATCAAGAAAAGCAGAATCAATGCAGATTCAAAGAGCTGGAGCTTCAACATGGATCCTGAGCTGCTGAGGAAGAAGAGGATTGCTGGCTACAAAGCTTATGGAGTTGAAGGCAAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797157.1
MEKFSRSKSTRDEYMQPRSMNDLRSYSTSDYNPPHHHQNLDENFKEMKIKKSRINADSKSWSFNMDPELLRKKRIAGYKAYGVEGKMKSSFRKSFRWIKDACTNVVNGFR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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