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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004394`

染色体: Chr02 坐标: 66294410-66296952 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004394`
名称	SmilChr02G004394
描述	coatomer subunit zeta-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66294410 - 66296952 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013142`
GeneID	`131013142`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013142`
原始查询	`LOC131013142`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	coatomer subunit zeta-1-like
产物	coatomer subunit zeta-1-like
Arabidopsis	`AT1G60970` (AT1G60970) SNARE-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842388] identity=78.4; qcov=0.962; evalue=1.79e-103; confidence=high
Rice	`Os02g0317400` (COPZ2) - identity=75.4; qcov=0.978; evalue=7.1e-100; confidence=high
GO	GO:0006886 (intracellular protein transport); GO:0006890 (retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum); GO:0006891 (intra-Golgi vesicle-mediated transport); GO:0030126 (COPI vesicle coat)
KEGG	-
Pfam	PF01217 (Clat_adaptor_s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013142

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797160.1`
2	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057797160.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797160.1`
4	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.60000	`XP_057797160.1`
5	Endosome	内体	0.40000	`XP_057797160.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66295046`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B78
`Chr2:66295055`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C31,C7
`Chr2:66295745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B95,C14
`Chr2:66295758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B130,B36,B82,B86
`Chr2:66295830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797160.1

183 aa

183

Clat_adaptor_s

PF01217 Clat_adaptor_s 12-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797160.1`	Pfam	`PF01217`	Clat_adaptor_s	Domain	12	152	2.1e-21	77.1	Clathrin adaptor complex small chain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941177.1
GAGCTTAGAAAATTATTGAATTTTAATCTTAGACTTCACCGTTTACAAAAACAATACCACCATCGATGAATCGACATAGGGTCACCCTCATCCTAATAAATAAATGAATTAGATACTACATCTAGGGAATCGAATAATGCATAATATTTATCTCAAATTGACCAAGAATTTAATTTCAACTATTAATAGATTGGGCTTATACAAAACCTCGTAGTATTGGGCCATATTTTTTAACTTGCAATCTACATTTTGATCGCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013142
ATGGCCACGTTTCTCAGTCATGAGACTTGCCCTACTATAAAGAACATACTTTTGCTGGATTCCGAGGGGAAGCGCATTGCAGTTAAGTACTACTCAGATGACTGGCCGACGAATGCTGCAAAGCTTGCATTCGAAAAATCTGTTTTTACAAAGACTCAAAAAACCAATGCTCGGACTGAAGCGGAGATAACAATGCTGGAGAACAACATAATCGTGTATAAGTTTGTTCAAGATCTGCACTTCTTTGTGACTGGGGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797160.1
MATFLSHETCPTIKNILLLDSEGKRIAVKYYSDDWPTNAAKLAFEKSVFTKTQKTNARTEAEITMLENNIIVYKFVQDLHFFVTGGDDENELILATVLQGFFDAITLLLRNNVDQREALENLDMILLCLDGIVDGGIILETDGSIIAGKVAIHSMDDGAPLSEQTISQALATAREHLTRSLLK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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