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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004417`

染色体: Chr02 坐标: 66509396-66512117 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004417`
名称	SmilChr02G004417
描述	glycosyltransferase BC10-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66509396 - 66512117 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013168`
GeneID	`131013168`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013168`
原始查询	`LOC131013168`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glycosyltransferase BC10-like
产物	glycosyltransferase BC10-like
Arabidopsis	`AT5G11730` (AT5G11730) Core-2/I-branching beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831045] identity=57.1; qcov=1; evalue=2.55e-158; confidence=high
Rice	`Os03g0731050` - identity=64; qcov=0.784; evalue=4.68e-149; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0016757 (glycosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02485 (Branch)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013168

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057797200.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057797200.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797200.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797200.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797200.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66510501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B118
`Chr2:66510552`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B53,B71,C45
`Chr2:66510646`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B118,B78,C27,C8
`Chr2:66511333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C31,C7
`Chr2:66511384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B65
`Chr2:66511415`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C57
`Chr2:66511415`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C57
`Chr2:66511573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C45,C83
`Chr2:66511652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B118,B78,C8
`Chr2:66511701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C30
`Chr2:66511792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797200.1

393 aa

196

393

Branch

PF02485 Branch 123-349 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797200.1`	Pfam	`PF02485`	Branch	Family	123	349	1.1e-79	268.3	Core-2/I-Branching enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941217.1
CTCCAGTTCCCTTAAATTAATTCGCCCATATTTTTCTCATTTTATTTTTCCCGACTTCCCTAAAATCAGCATATTATATTTTCCAAACCCAATCATGAATCTCCCTCTCACATCATCACTGCACCATCTCTCATCAATGTTGATTTTAATGCCCCAAGACTGCAGCATCATCGATCACAAGTGCTTCCAACGTTTTCTAAAGAATAAATTTAAAGCATTCATAAAACTCAGAATCAGTTTCATTCTTCTAACCCAAACGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013168
ATGCAATCTAGAGTGGGAAGTTTTAGCTCATTAGAGGAAGGCCAAATTCCTCTAAGGATTATGCACCAATACAGCAAACATCTGCCTCTTAGGCTGCTGCTTCTCTTCCTCTTGTTAGGGGTAGGCCTAGTGTTTCTGTATATCAGTATGTATACGTACCGGTATATCAGCATCCACAGCGTTGCTTCCTCGACTGCTGCCTCGAGGATTCAGACACACCACGGCTGTGTCCAAGGATCGAAGGGTTTGGAGAGCTGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797200.1
MQSRVGSFSSLEEGQIPLRIMHQYSKHLPLRLLLLFLLLGVGLVFLYISMYTYRYISIHSVASSTAASRIQTHHGCVQGSKGLESWIRPPSSLLHEMNDTELFWRATLVPMIEKYPFKRTPKIAFMFLTRGPLPLAPLWDRFFKGNERLYSIYIHSSPSYEPEFEPSSAFYGRQIPSQVAEWGRMNMCDAERRLLANALLDISNEWFVLVSEACIPLQNFTTIYTYISQSHFSFLGAFDEDGPYGRGRYNEGMAPEVNLS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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