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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004420`

染色体: Chr02 坐标: 66525971-66527914 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004420`
名称	SmilChr02G004420
描述	60S ribosomal protein L28-1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66525971 - 66527914 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013171`
GeneID	`131013171`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013171`
原始查询	`LOC131013171`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L28-1-like
产物	60S ribosomal protein L28-1-like
Arabidopsis	`AT2G19730` (AT2G19730) Ribosomal L28e protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816492] identity=74.8; qcov=1; evalue=4.74e-75; confidence=high
Rice	`Os01g0706500` - identity=75; qcov=1.01; evalue=3.73e-78; confidence=high
GO	GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01778 (Ribosomal_L28e)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013171

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797204.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797204.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797204.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797204.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797204.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66526423`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:66526462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:66526468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr2:66527618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B12,B124
`Chr2:66527624`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B10,B12,B124
`Chr2:66527624`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B10,B12,B124
`Chr2:66527636`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B12,B124
`Chr2:66527640`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B12,B124

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797204.1

143 aa

143

Ribosomal_L28e

PF01778 Ribosomal_L28e 8-127 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797204.1`	Pfam	`PF01778`	Ribosomal_L28e	Family	8	127	1.1e-36	126.6	Ribosomal L28e protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941221.1
TGGTAGGGCAGTTTTGTAACTTCACACCACCATTGCTAGGGTTTATAACTTCCCAATATATAGCGCTAAAAATCACTCCTTTCGTCAGCTACCTTCACTCTCGAGGCCGTCAGAGCAAAACCCTAGATTCTTCAACTCTTCTCCCTCTACGGGTTTGCGCGTTTGAGAAATGGCGACGGTGCCGGGGCAGCTCATATGGGAGATCGTGAAGAAAAACAACTCCTTTTTGGTGAAGGAGTTCGGAAATGGAACTGCTAGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013171
ATGGCGACGGTGCCGGGGCAGCTCATATGGGAGATCGTGAAGAAAAACAACTCCTTTTTGGTGAAGGAGTTCGGAAATGGAACTGCTAGCGTGAAGTTCAGCAAGGAGCCCAACAATCTCTACAACATCCACTCCTTCAAGCACTCAGGATTGGCAAACAAGAAAACTGTGACCATTCAACCTGGAAAGGATCAGACCGTGGTCCTTGCAACCACAAAGACAAAGAAGCAGAACAAGCCCTCCAGCCTGCTCAACAAGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797204.1
MATVPGQLIWEIVKKNNSFLVKEFGNGTASVKFSKEPNNLYNIHSFKHSGLANKKTVTIQPGKDQTVVLATTKTKKQNKPSSLLNKSVMKKEFHRMAKAVSNQVCDNYYRPDLKKAALARLSVVHRSLKVSKSGSKKRNRQSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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