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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004436`

染色体: Chr02 坐标: 66749520-66753009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004436`
名称	SmilChr02G004436
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66749520 - 66753009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013188`
GeneID	`131013188`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013188`
原始查询	`LOC131013188`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
产物	ankyrin repeat-containing protein At5g02620-like
Arabidopsis	`AT5G35830` (AT5G35830) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833569] identity=32.6; qcov=0.574; evalue=6.55e-23; confidence=low
Rice	`Os11g0435800` (OsSTA258) - identity=29.1; qcov=0.699; evalue=1.62e-11; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF12796 (Ank_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013188

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797235.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797235.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797235.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797235.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797235.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66749770`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B99
`Chr2:66749770`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B99
`Chr2:66749894`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A10,A20,A3,B101,B107,B112,B114,B115,B132,B26,B27,B41,B5,B53,B57,B58,B6,B60,B74,B8,B90,B92,C1,C19,C20,C28,C38,C43,C53,C54,C59,C70,C83,C87
`Chr2:66749933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B77,D10
`Chr2:66750042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B125,B41,B90,B92
`Chr2:66750055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B125,B41,C20
`Chr2:66750116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B29
`Chr2:66750156`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,B120,B122,B19,B40,B55,B69,B73,B74,B77,C29,C30,C45,C6,C83,C87,D1,D10
`Chr2:66750159`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A10,B120,B122,B19,B40,B55,B69,B73,B74,B77,C29,C30,C45,C6,C83,C87,D1,D10
`Chr2:66750173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B120,B19,B77
`Chr2:66752891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B110,C67
`Chr2:66752896`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797235.1

256 aa

128

256

Ank_2

PF12796 Ank_2 75-162 aa PF12796 Ank_2 136-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797235.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	75	162	7.6e-16	59.2	Ankyrin repeats (3 copies)
`XP_057797235.1`	Pfam	`PF12796`	Ank_2	Repeat	136	194	7.6e-16	59.2	Ankyrin repeats (3 copies)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941252.1
ACGGAGCACACATCTTTGTTTTCGACGATAAATATCGCTCCTATCCTATATAATAGGCTACGAACGGAATTAAAAAAAGAAATTTGTGGTGCTAGATGAAGAGAATATTGACAAGTAGGAGTGGGAGGGAAATGTATGGCCCCAAATGGCAGAATATGGAATCATCAACTAGTTCCGAAAATAAGGATGATGATGATGCACTTCATTCAGCTTCCACTCAAACAACTACTGCACCACCGCTACCCCTCACTCCAACTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013188
ATGAAGAGAATATTGACAAGTAGGAGTGGGAGGGAAATGTATGGCCCCAAATGGCAGAATATGGAATCATCAACTAGTTCCGAAAATAAGGATGATGATGATGCACTTCATTCAGCTTCCACTCAAACAACTACTGCACCACCGCTACCCCTCACTCCAACTCCCCAAGGGATTAGTAGACGAAGAATTAATTGTCTTTCAAATAGTCATGAATCAATGTACAGAGCTACACTAGAGGGTGATTGCGTAGCTGTTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797235.1
MKRILTSRSGREMYGPKWQNMESSTSSENKDDDDALHSASTQTTTAPPLPLTPTPQGISRRRINCLSNSHESMYRATLEGDCVAVEMLLEGDPKLASDEISEEGDRALHVAAAIKHKQIVRKLVEKLSASELALLDGHGYTACCYAALSGTVDIVDLMMRKNSSLATARDWENTTPLYKAAFRGNAKMVSYFLGSAKLEDLSIEEWFDLLLVTIRREMYDVALKISGSNEQLATMRNDEGTALHLLAKQSLFGDSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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