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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G004440`

染色体: Chr02 坐标: 66770330-66774028 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G004440`
名称	SmilChr02G004440
描述	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	66770330 - 66774028 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013191`
GeneID	`131013191`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013191`
原始查询	`LOC131013191`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
产物	ankyrin repeat-containing protein ITN1-like
Arabidopsis	`AT5G35810` (AT5G35810) Ankyrin repeat family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833567] identity=35.8; qcov=0.549; evalue=1.86e-55; confidence=medium
Rice	`Os11g0251200` - identity=21.1; qcov=0.884; evalue=4.96e-13; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF13962 (PGG)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013191

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797237.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797237.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797237.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797237.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797237.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:66770562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C19,C71,C85
`Chr2:66770817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr2:66770821`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr2:66772880`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A25,B56,B96
`Chr2:66772880`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A25,B56,B96
`Chr2:66772901`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C31
`Chr2:66773194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A7,C31
`Chr2:66773194`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C31
`Chr2:66773198`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A7,C31
`Chr2:66773261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,D10
`Chr2:66773830`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	55	A11,A18,A19,A3,A6,A8,B1,B100,B112,B12,B127,B13,B130,B135,B136,B137,B139,B30,B36,B41,B46,B48,B51,B53,B6,B65,B78,B86,B89,B94,C28,C32,C33,C38,C40,C5,C52,C54,C57,C64,C66,C67,C68,C70,C71,C74,C77,C79,C8,C82,C86,C87,D1,D11,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797237.1

642 aa

321

642

PGG

PF13962 PGG 460-573 aa

XP_057797238.1

621 aa

310

621

PGG

PF13962 PGG 439-552 aa

XP_057797239.1

605 aa

302

605

PGG

PF13962 PGG 423-536 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797237.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	460	573	1.7e-18	67.2	Domain of unknown function
`XP_057797238.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	439	552	1.7e-18	67.2	Domain of unknown function
`XP_057797239.1`	Pfam	`PF13962`	PGG	Domain	423	536	1.7e-18	67.2	Domain of unknown function

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941254.1
TATACAAGAAGTTAAAACGATACTTAATAATTCATGTCGGGCCCATAACAGAAAAATAAGGAGAAGTTTTCAATCTTGATGGCAGTCAATTTTATTTCTACAGCACACATTCTCACTTCACATGTGGTGGTTTAGAGCTAAGATCACCAAGTGTTTGTGAAAAGTCCCGACCGAGAATTCTTTGCTGATTCTTGAACAACTAATAAGCTAGGATGAGTCATCCAAATCGAGACGCAGCAGATTCAACCGAAATTGTTGAC...

XM_057941256.1
TATACAAGAAGTTAAAACGATACTTAATAATTCATGTCGGGCCCATAACAGAAAAATAAGGAGAAGTTTTCAATCTTGATGGCAGTCAATTTTATTTCTACAGCACACATTCTCACTTCACATGTGGTGGTTTAGAGCTAAGATCACCAAGTGTTTGTGAAAAGTCCCGACCGAGAATTCTTTGCTGATTCTTGAACAACTAATAAGCTAGGATGAGTCATCCAAATCGAGACGCAGCAGATTCAACCGAAATTGTTGAC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013191
ATGAGTCATCCAAATCGAGACGCAGCAGATTCAACCGAAATTGTTGACGACGTTTCAAATATTCAACCTACATCAGCAGCATCAACCGTGATCGAAACAAACTTTTCTCCAACAGCTGAAGATAACACAAATCAGAATTGGAAAGGGAAAAGAAGGGGAAGCCGTAGTTGGTTAATGTATAGAGCTGCACTGGGAGGCGACTGGGCAGCCGCGGAAGCGCTTCTGAAGCAAGATCGGAGCTTAGCAAGCGACGTGTTAAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797237.1
MSHPNRDAADSTEIVDDVSNIQPTSAASTVIETNFSPTAEDNTNQNWKGKRRGSRSWLMYRAALGGDWAAAEALLKQDRSLASDVLTERGDRALHLAIAMKHKKFVQKLVEWMSPSELELPDMSGDNACCYAAMSGSVQIANLLVAKNGRFLVARNKDNYTPLQYSILGGERKMISFFLEKTGVDRLSQAEWFHLLLKAIASRMYDVALKILEKDGSLATVRSAVTALHVLARQDISKVSTSKTAILFKSILGTSFYGRQ...

XP_057797238.1
MSHPNRDAADSTEIVDDVSNIQPTSAASTVIETNFSPTAEDNTNQNWKGKRRGSRSWLMYRAALGGDWAAAEALLKQDRSLASDVLTERGDRALHLAIAMKHKKFVQKLVEWMSPSELELPDMSGDNACCYAAMSGSVQIANLLVAKNGRFLVARNKDNYTPLQYSILGGERKMISFFLEKTGVDRLSQAEWFHLLLKAIASRMYDVALKILEKDGSLATVRSAVTALHVLARQDISKVSTSKTAILFKSILGTSFYGRQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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