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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001547`

染色体: Chr02 坐标: 28764850-28769645 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001547`
名称	SmilChr02G001547
描述	cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28764850 - 28769645 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013213`
GeneID	`131013213`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013213`
原始查询	`LOC131013213`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein
产物	cytochrome c-type biogenesis ccda-like chloroplastic protein
Arabidopsis	`AT5G54290` (CcdA) cytochrome c biosis protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835517] identity=69.2; qcov=0.942; evalue=7.92e-138; confidence=high
Rice	`Os11g0140800` (CCDA1) - identity=81.5; qcov=0.755; evalue=2.84e-153; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0017004 (cytochrome complex assembly)
KEGG	-
Pfam	PF02683 (DsbD_TM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013213

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797265.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057797265.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057797265.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057797265.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28765139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C1
`Chr2:28765357`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr2:28765600`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr2:28765617`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,C1
`Chr2:28765631`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B16,B75,C87,D4
`Chr2:28765652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr2:28765653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B49,B79,C20,C36
`Chr2:28766377`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr2:28766464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,A3,B127,B42,C50
`Chr2:28767092`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B126
`Chr2:28767952`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C48
`Chr2:28767952`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797265.1

359 aa

180

359

DsbD_TM

PF02683 DsbD_TM 138-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797265.1`	Pfam	`PF02683`	DsbD_TM	Domain	138	319	2.1e-24	86.7	Cytochrome C biogenesis protein transmembrane domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941282.1
TTTTTGTTGTTTTTGAATTAATTGTGTTTGTGAATGTGATAATTTGACAGCCACGTCACCGTGAAAGCGTATGTGGCGTGATTAATTAACAAGACGCTTCAATGAGTAGCAAAAATCCAACGAGAAATCAACACCTCTGACTTTCAGTTTCTCAATAGAAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAGATTCAAATGAAGTTGGCCTTACTAAGCAGCTTTGGCAGCAACTCCAGCTGCTCTCGCTTCATACCAGTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013213
ATGAAGTTGGCCTTACTAAGCAGCTTTGGCAGCAACTCCAGCTGCTCTCGCTTCATACCAGTTTCGAGTTTCAATCGTCTACCCATCAATTGTCATGATATTCATGATAAGCAGCAGTCCTTAAACCTGAAGCGTCGCCATGATAATGGAGAAATTGTTAGTAGCATTTCATTGTCCAAGACTACCAGTATTGATTTTACTAGTGCCCTCATAAATTCATTTGCAGCTGCAGCTTTCATTGCAACGCCTTTAGCAAGTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797265.1
MKLALLSSFGSNSSCSRFIPVSSFNRLPINCHDIHDKQQSLNLKRRHDNGEIVSSISLSKTTSIDFTSALINSFAAAAFIATPLASASTIETIAEIPDSIYTLADGSSGDWLSGLLFSASQDANAAVQDQLTSFSFTSLVVIFGAGLVTSLSPCTLSVLPLTLGYIGAFGSGKSKTEVIGNSVSFAMGLATTLALLGVAASFAGKAYGQIGQGLPVAASSLAIIMGLNLLEVFELQLPSFFNNFDPRAAAANFPSSVQAY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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