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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001559`

染色体: Chr02 坐标: 28868289-28869132 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001559`
名称	SmilChr02G001559
描述	uncharacterized SmilChr02G001559
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	28868289 - 28869132 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013222`
GeneID	`131013222`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013222`
原始查询	`LOC131013222`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0006508 (proteolysis); GO:0008234 (cysteine-type peptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF02902 (Peptidase_C48)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013222

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797279.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057797279.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797279.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797279.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797279.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:28868365`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr2:28868372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C55,C8,D9
`Chr2:28868379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr2:28868420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	36	A13,A14,A3,A6,A8,B100,B104,B110,B115,B130,B132,B135,B18,B2,B23,B32,B48,B52,B58,B60,B63,B65,B70,B75,B83,B9,B98,C10,C28,C35,C43,C54,C6,C75,C86,D5
`Chr2:28868426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B51,B93,C44
`Chr2:28868449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B126,B51
`Chr2:28868470`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	92	A10,A11,A14,A19,A25,A4,A8,A9,B1,B100,B102,B104,B107,B114,B118,B121,B123,B133,B134,B139,B15,B19,B20,B23,B26,B27,B28,B3,B30,B34,B40,B44,B45,B48,B49,B5,B53,B54,B55,B60,B61,B63,B64,B68,B69,B77,B78,B81,B83,B85,B87,B89,B98,C1,C13,C15,C17,C2,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C40,C41,C43,C46,C5,C51,C53,C58,C6,C61,C62,C63,C66,C69,C74,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C85,C86,C87,D4,D5,D8
`Chr2:28868476`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr2:28868487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:28868495`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C15,C84
`Chr2:28868584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	39	A14,A6,A8,B115,B130,B18,B19,B23,B30,B34,B42,B43,B48,B52,B58,B63,B65,B70,B73,B82,B83,B86,B9,C10,C12,C22,C26,C35,C37,C41,C43,C50,C54,C72,C75,C85,C86,C87,D5
`Chr2:28868642`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797279.1

180 aa

180

Peptidase_C48

PF02902 Peptidase_C48 104-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797279.1`	Pfam	`PF02902`	Peptidase_C48	Domain	104	158	7.5e-06	26.7	Ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941296.1
AGGCTACATTGAAGTTGAAGGCAACCGATGTACCAACGACATTAAAGATGTTGCACAAATACGCAAGTGTTGCACTCAATGGTGGTCGCACTATTCAATTCACCTTGGATCCTAATGTCTTTGGTAATAATCGAGAAGTTTTTGTTGAATTTGATGAAATCCACAAAATGTGTGAATTGGAGCCTATCGCAGCATCGAGCATTTGTGTCTACATATGGCACTTATACAAGGAGTGTGAGGCTTCAAACATTCTTGATAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013222
ATGTTGCACAAATACGCAAGTGTTGCACTCAATGGTGGTCGCACTATTCAATTCACCTTGGATCCTAATGTCTTTGGTAATAATCGAGAAGTTTTTGTTGAATTTGATGAAATCCACAAAATGTGTGAATTGGAGCCTATCGCAGCATCGAGCATTTGTGTCTACATATGGCACTTATACAAGGAGTGTGAGGCTTCAAACATTCTTGATAGAATTCGATTTGTTGATCCATATTTGGTATCATGCGATCCAAGTGTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797279.1
MLHKYASVALNGGRTIQFTLDPNVFGNNREVFVEFDEIHKMCELEPIAASSICVYIWHLYKECEASNILDRIRFVDPYLVSCDPSVDQNEQASRLGQRLIGTKNNQLVMMPCNVGWHWILLVIDPHKETVYALDPLLDGTHVEDWKSMMTLAMKMFNMSIGTRGMKNPSWETINVCNSLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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