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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001579`

染色体: Chr02 坐标: 29470400-29472111 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001579`
名称	SmilChr02G001579
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29470400 - 29472111 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013237`
GeneID	`131013237`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013237`
原始查询	`LOC131013237`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAC domain-containing protein JA2-like
产物	NAC domain-containing protein JA2-like
Arabidopsis	`AT4G27410` (RD26) NAC (No Apical Meristem) domain transcriptional regulator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828849] identity=62.4; qcov=1; evalue=5.87e-127; confidence=high
Rice	`Os01g0816100` (OsNAC4) - identity=67.7; qcov=0.533; evalue=5.05e-81; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02365 (NAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013237

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797294.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797294.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797294.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797294.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797294.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29470703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:29470900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr2:29470935`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr2:29471042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr2:29471361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr2:29471388`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	69	A16,A3,A4,A5,B101,B104,B106,B107,B114,B12,B120,B121,B124,B131,B132,B137,B14,B16,B19,B2,B26,B27,B35,B37,B42,B45,B47,B5,B52,B55,B56,B59,B60,B67,B69,B7,B71,B75,B86,B96,B97,C1,C10,C16,C19,C2,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C30,C31,C35,C37,C39,C4,C50,C56,C59,C70,C72,C78,C8,C84,D2,D4,D7
`Chr2:29471390`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	68	A16,A3,A4,A5,B101,B104,B106,B107,B114,B12,B120,B121,B124,B131,B132,B137,B14,B16,B19,B2,B26,B27,B35,B37,B42,B47,B5,B52,B55,B56,B59,B60,B67,B69,B7,B71,B75,B86,B96,B97,C1,C10,C16,C19,C2,C21,C22,C25,C26,C28,C29,C30,C31,C35,C37,C39,C4,C50,C56,C59,C70,C72,C78,C8,C84,D2,D4,D7
`Chr2:29471396`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	66	A16,A3,A4,A5,B101,B104,B106,B107,B114,B12,B120,B121,B124,B131,B132,B137,B14,B16,B19,B2,B26,B27,B35,B37,B47,B5,B52,B55,B56,B59,B60,B67,B69,B7,B71,B75,B86,B97,C1,C10,C13,C16,C19,C2,C22,C25,C26,C28,C29,C30,C31,C35,C37,C39,C4,C50,C56,C70,C78,C8,C84,C9,D2,D4,D7,D9
`Chr2:29471491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797294.1

319 aa

160

319

NAM

PF02365 NAM 15-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797294.1`	Pfam	`PF02365`	NAM	Family	15	139	2.2e-48	164.5	No apical meristem (NAM) protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941311.1
CCGTTTACCATAGGATAAGGTCGGCCATTTGATACAAGCCGAACACCCTCTACGTGTCACGTTTTAAACGGTGTCCCCGTGGGCCCCACATGACACAGACCAATCCGTACTCAACACCCCGCCCCTTCTATATATACACAACCGCCTCCTCTCATTTCCGGAGGAAAAAAGAAGAAAAATCTAAATATTCTCAACGATAAAAAAAACACAATTGAGAATATCTTTGCATTACTCTCTCACTGTTTGATTGATCTTGTATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013237
ATGGGCGTCCGAGAAAGCGACCCGCGCTCGCAGCTGAGTCTTCCGCCGGGATTCAGGTTTTTTCCGACGGACGAGGAGCTGCTCGTGCAGTATCTCTGCCGGAAAGTCGCCGGCCACCATTTCCCGCTGCAGATCATTGGAGATGTTGATTTGTACAAGTTCGATCCATGGGATCTTCCAAGTAAAGCTTTGTTTGGGGAGAAAGAATGGTATTTCTTCAGCCCAAGAGACAGAAAATATCCCAACGGTTCGCGGCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797294.1
MGVRESDPRSQLSLPPGFRFFPTDEELLVQYLCRKVAGHHFPLQIIGDVDLYKFDPWDLPSKALFGEKEWYFFSPRDRKYPNGSRPNRVAGSGYWKATGTDKIITTEGRKVGIKKALVFYVGKAPKGTKTNWIMHEYRLSESSRKNGSSKLDDWVLCRIYKKNSSGQDRSAALAGGVVQSKEYSHDSSSSCSSQYDDVLDSLPELDDRYFSMDSLKNSQLQDDQKLNLQRLSSGNFDWATLAGLGPLWPELLQAQQTSAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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