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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001580`

染色体: Chr02 坐标: 29518751-29520300 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001580`
名称	SmilChr02G001580
描述	uncharacterized SmilChr02G001580
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29518751 - 29520300 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013240`
GeneID	`131013240`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013240`
原始查询	`LOC131013240`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0195100; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0195100; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0195100` - identity=27.7; qcov=0.88; evalue=7.83e-07; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03004 (Transposase_24)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013240

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797296.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797296.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797296.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797296.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797296.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29519418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C59
`Chr2:29519426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B34
`Chr2:29519443`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C48
`Chr2:29519444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	47	A1,A10,A13,A4,A5,A6,A8,B103,B105,B113,B118,B121,B126,B127,B131,B136,B23,B27,B29,B33,B36,B38,B44,B47,B5,B64,B65,B89,B90,B97,C1,C11,C34,C39,C4,C51,C55,C60,C62,C69,C7,C74,C75,C79,C85,C9,D5
`Chr2:29519448`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A18,A19,B109
`Chr2:29519454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B28,C66
`Chr2:29519525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B10
`Chr2:29519526`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A10,A4,A8,B103,B127,B128,B20,B23,B44,B47,B90,C31,C51,C55,C69,C75,C85
`Chr2:29519527`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A1,A10,A4,A8,B103,B127,B128,B20,B23,B44,B47,B90,C31,C51,C55,C69,C75,C85
`Chr2:29519537`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B35,C71,C72
`Chr2:29519545`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,B10
`Chr2:29519590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797296.1

209 aa

104

209

Transposase_24

PF03004 Transposase_24 36-158 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797296.1`	Pfam	`PF03004`	Transposase_24	Family	36	158	1.4e-13	51.9	Plant transposase (Ptta/En/Spm family)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941313.1
GAGTCATATCGTGAGCATACGTTGGAGCACATGAGTGTTTTGTGGGGAGCTTGGAGATCAAAGTTGTATGCAGATCACGTGAAACCTTACAAAAACAAGATCAATGCTTTAAAAAAGGTTCCACGTGGGATGAATGATAAAGATTGGGAATGGCTCGTAACTAACAAGTTTCTAACTAAAGAGTTTCAGGATATCAGTGAGCGAAATTCTAAGAATCGATCAAAATCTGATTTGTTTATGCTTCATCTTACTGGGAGCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013240
ATGAGTGTTTTGTGGGGAGCTTGGAGATCAAAGTTGTATGCAGATCACGTGAAACCTTACAAAAACAAGATCAATGCTTTAAAAAAGGTTCCACGTGGGATGAATGATAAAGATTGGGAATGGCTCGTAACTAACAAGTTTCTAACTAAAGAGTTTCAGGATATCAGTGAGCGAAATTCTAAGAATCGATCAAAATCTGATTTGTTTATGCTTCATCTTACTGGGAGCAGACCACATAGAGAAATCATTTATGACAAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797296.1
MSVLWGAWRSKLYADHVKPYKNKINALKKVPRGMNDKDWEWLVTNKFLTKEFQDISERNSKNRSKSDLFMLHLTGSRPHREIIYDKGGKNSEMPDLGIIFFETRSKNGKFKGTKEKDKYDEIVETIQSNPSLSNLELAEKCFGPQQHGIVYGYGGGVKRKTFHDWKSSYTKELEEKLSAKDEENRLLRKRVDRLEERFDQWERSGLPSE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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