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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001584`

染色体: Chr02 坐标: 29587041-29587627 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001584`
名称	SmilChr02G001584
描述	uncharacterized SmilChr02G001584
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29587041 - 29587627 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013242`
GeneID	`131013242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013242`
原始查询	`LOC131013242`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0564533; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0564533; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G42170` (DAYSLEEPER) BED zinc finger and hAT dimerization domain-containing protein DAYSLEEPER [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3769417] identity=41.7; qcov=0.457; evalue=1.06e-06; confidence=low
Rice	`Os07g0564533` - identity=66.7; qcov=0.457; evalue=9.29e-17; confidence=low
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797297.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797297.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797297.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797297.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797297.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29587203`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	9	A11,B122,B35,B38,B78,B83,B86,C36,C75
`Chr2:29587217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B59,B66,B89,C48
`Chr2:29587218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B117,C10,C71
`Chr2:29587239`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C83,C9
`Chr2:29587265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr2:29587272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B45,C18,C34,C87
`Chr2:29587272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,C18,C34,C87
`Chr2:29587379`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C67
`Chr2:29587380`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B130,B84,C75
`Chr2:29587402`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,C43
`Chr2:29587429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A7,B54,B76,C51
`Chr2:29587429`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B54,B76,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797297.1

105 aa

105

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 1-48 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797297.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	1	48	3.9e-15	56.1	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941314.1
AGCCCGCGCTTCCCTATTCTATCCGAGATGGTGAGGGACATCATGGCTATCCCTATATCGAGCGTTGCTTCTGAGTCTGCATTTAGCACGGGTAGTCGTGTTTTATCTAAACTTAGAAGCTCGTTGACTGTTAATATGCTGGAGGCTTTGATATGCGCTGAGGATTGGCTCAAATCTAGTTCGTCGGATAAATTTCTCCAAGATGAAGAAGATGTGTCTGAGACTGAGTTAGAGAAGGAGTTTGAATCGGTTTTGACACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013242
ATGGTGAGGGACATCATGGCTATCCCTATATCGAGCGTTGCTTCTGAGTCTGCATTTAGCACGGGTAGTCGTGTTTTATCTAAACTTAGAAGCTCGTTGACTGTTAATATGCTGGAGGCTTTGATATGCGCTGAGGATTGGCTCAAATCTAGTTCGTCGGATAAATTTCTCCAAGATGAAGAAGATGTGTCTGAGACTGAGTTAGAGAAGGAGTTTGAATCGGTTTTGACACAACTTGGGATGAGTGGAGGACATGGAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797297.1
MVRDIMAIPISSVASESAFSTGSRVLSKLRSSLTVNMLEALICAEDWLKSSSSDKFLQDEEDVSETELEKEFESVLTQLGMSGGHGVRGESSGDVPSQTSRSVLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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