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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001597`

染色体: Chr02 坐标: 29808667-29811140 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001597`
名称	SmilChr02G001597
描述	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	29808667 - 29811140 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013251`
GeneID	`131013251`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013251`
原始查询	`LOC131013251`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
产物	probable 2' cyclic ADP-D-ribose synthase BdTIR
Arabidopsis	`AT1G61105` (AT1G61105) Toll-Interleukin-Resistance (TIR) domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745840] identity=60.6; qcov=0.749; evalue=1.45e-68; confidence=high
Rice	`Os07g0566800` (OJ1092_A07.109) - identity=50.7; qcov=0.696; evalue=1.96e-48; confidence=medium
GO	GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF01582 (TIR); PF13676 (TIR_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013251

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797303.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797303.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057797303.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797303.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:29809206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B124,B22,C25,C30
`Chr2:29810304`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:29810307`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B5
`Chr2:29810340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr2:29810418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr2:29810503`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C73
`Chr2:29810503`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C73
`Chr2:29810529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr2:29810559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C59
`Chr2:29810595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr2:29810656`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	A16,B124,B131,B22,C30,D11
`Chr2:29810657`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	A16,B124,B131,B22,C30,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797303.1

207 aa

104

207

TIR

TIR_2

PF01582 TIR 27-125 aa PF13676 TIR_2 30-123 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797303.1`	Pfam	`PF01582`	TIR	Domain	27	125	5.5e-18	66.1	TIR domain
`XP_057797303.1`	Pfam	`PF13676`	TIR_2	Domain	30	123	2.5e-16	61.0	TIR domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941320.1
TTTACAACTAAAGAAAACGCACCTTAATTTAACTACTGTGGCTACCAGCTGAAGAAAAGAAAAGAAAAAAAAAAAGAATGCTTTCCTCTGACTAAATTTGAATTCATGGACTTTTCCTTGGACTAACTGTCAAATCACACGGTTATAAACTCACTCATTCCGTACGAAATAATAGTTCCCCACTATCTTTCCCTTTCAAAATTCAATGTCAAACGTTGAAACTCCACCACATTTTAAATCCGCATGCAGATGAATAAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013251
ATGCAACGCTCAATAGCCATGAACTTAGTGAACAAGAACCAAGTTAGAGCGAGAATTGTGAGAGCGGGGTCGGCGTCGGCGTACGACGTGTTCATCAACCACAGGGGGACGGACACGAAGCGGACGGTGGCGACGCTGTTGTACGACCATCTTTTCCGGCAACGGATCAGGCCGTTTTTGGACAACAAGAGCATGAAGGCGGGCGACAAGCTGTTCGACAAAATTGATAATGCGGTGGGCGGGTGCAAGATCGGCGTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797303.1
MQRSIAMNLVNKNQVRARIVRAGSASAYDVFINHRGTDTKRTVATLLYDHLFRQRIRPFLDNKSMKAGDKLFDKIDNAVGGCKIGVAVFSPRYCDSYFCLHELALMMSLKKKVIPIFCDVKPSQLSIVDDGTMSPEDVRRFALALEEAKYTVGLEFDSYKGNWSDVVKNAANIVIDSLAEIEDDERLIHNNNFSFYKTPPFAAPKSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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