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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001613`

染色体: Chr02 坐标: 30015936-30017916 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001613`
名称	SmilChr02G001613
描述	uncharacterized SmilChr02G001613
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30015936 - 30017916 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013261`
GeneID	`131013261`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013261`
原始查询	`LOC131013261`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fiber (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820787]; symbol=AT3G15480; hit=AT3G15480; species=arabidopsis; confidence=high
产物	fiber (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820787]; symbol=AT3G15480; hit=AT3G15480; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G15480` (AT3G15480) fiber (DUF1218) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820787] identity=70.8; qcov=0.929; evalue=2.14e-88; confidence=high
Rice	`Os07g0462200` - identity=73.5; qcov=0.902; evalue=4.88e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06749 (DUF1218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013261

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797311.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797311.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797311.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797311.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30017301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:30017350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C81
`Chr2:30017532`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A25
`Chr2:30017532`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A25
`Chr2:30017665`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr2:30017681`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797311.1

184 aa

184

DUF1218

PF06749 DUF1218 58-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797311.1`	Pfam	`PF06749`	DUF1218	Family	58	153	5.7e-34	117.2	Protein of unknown function (DUF1218)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941328.1
CCTATTTTATCACAGCTTACTAATTACTCAACTTCTCTATATCAGACTACATGTAGAGAGAGAAACTCAAGGCACGGCCTGAAGGAGCAACTGAGAGATCCAGATCTGCCGCTACTTCAATGGCTTCCAAGATCTTACTCATCATTGTCTTCATTTTCGATCTCATAGCTTTCGGTTTGGCAGTTGCTGCTGAGCAGAGAAGAAGCACGGGCACAACAGAGAGAGATAGTGATGATAACTATAAATACTGTGTTTACAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013261
ATGGCTTCCAAGATCTTACTCATCATTGTCTTCATTTTCGATCTCATAGCTTTCGGTTTGGCAGTTGCTGCTGAGCAGAGAAGAAGCACGGGCACAACAGAGAGAGATAGTGATGATAACTATAAATACTGTGTTTACAGCTCCGATATTGCAACTGGGTATGGTGTTGGTGCGTTTCTATTGTTGATGGCAAGTCAAGTGATTATAATGGCTGCAAGTAGATGCTTCTGCTGTGGGACTCCGCTGAAACCTGGAGGTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797311.1
MASKILLIIVFIFDLIAFGLAVAAEQRRSTGTTERDSDDNYKYCVYSSDIATGYGVGAFLLLMASQVIIMAASRCFCCGTPLKPGGSRACAVLLFIFCWVTFLIAEACLLAGSVRNAYHTKYRRMFFDQEPSCETVRKGVFAAGAAFTLFTAIVSEFYYVSYSKSRGSYRAHGGDAAVGMTAFK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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