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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001660`

染色体: Chr02 坐标: 30781168-30782998 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001660`
名称	SmilChr02G001660
描述	uncharacterized SmilChr02G001660
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30781168 - 30782998 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013304`
GeneID	`131013304`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013304`
原始查询	`LOC131013304`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin M-type 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820775]; symbol=TRX-M4; hit=AT3G15360; species=arabidopsis; confidence=high
产物	thioredoxin M-type 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820775]; symbol=TRX-M4; hit=AT3G15360; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G15360` (TRX-M4) thioredoxin M-type 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820775] identity=51.5; qcov=1.1; evalue=3.74e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0639900` (OsTRXM1) - identity=59.2; qcov=0.835; evalue=1.52e-56; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity); GO:0016671 (oxidoreductase activity, acting on a sulfur group of donors, disulfide as acceptor)
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2); PF14595 (Thioredoxin_9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013304

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797365.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057797365.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797365.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797365.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30781515`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B72,B77,B93,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797365.1

176 aa

176

Thioredoxin

Thioredoxin_2

Thioredoxin_9

PF00085 Thioredoxin 73-173 aa PF13098 Thioredoxin_2 87-174 aa PF14595 Thioredoxin_9 96-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797365.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	73	173	6.9e-30	103.8	Thioredoxin
`XP_057797365.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	87	174	1.2e-07	32.7	Thioredoxin-like domain
`XP_057797365.1`	Pfam	`PF14595`	Thioredoxin_9	Family	96	166	3.1e-06	27.8	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941382.1
ACAATATGAAAGTATTCCTCGTCCATTCATAATCGTAAAAATCAAAATATCAGATCCCCGCTTTGAAACAAAAGTGATATAAATAAGACTCAACCACTCTCTCCTCCCCAACTTATCCAACCACCAGCCCTCGCACAACACACATTCTGTGTGAGTGTGAATTTTCGCCATGGCCGGAGTCCTAGAAACCCTAATGATTCCTCGCGCCTCCGCTCTCCCGTCCGCATCCTTGCCGCCGGTCGCCGCATCCGCCTCCGTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013304
ATGGCCGGAGTCCTAGAAACCCTAATGATTCCTCGCGCCTCCGCTCTCCCGTCCGCATCCTTGCCGCCGGTCGCCGCATCCGCCTCCGTCCGATTTCCAGAGTTGAGGGGTCTCAAGATGCAACCAACTCGGTCGTCGGCAAAGCTCAGGACCACTCACAAACTTGCTCGAGGTGGCAGTAGAATCGTTTGCGAGGCGCAGGACACAGCTGTTGGAGTGGCTGCTGTTACTGATCCGGACTGGCAATCTCTTGTGCTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797365.1
MAGVLETLMIPRASALPSASLPPVAASASVRFPELRGLKMQPTRSSAKLRTTHKLARGGSRIVCEAQDTAVGVAAVTDPDWQSLVLESDLPVLVEFWAPWCGPCRMIHPVIDKLAKDYAGKLKCFKVNTDDCSTIATQYGIRSIPTVIIFKNGEKKEAVIGAVPETTLTTCIEKYL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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