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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001670`

染色体: Chr02 坐标: 30959141-30961050 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001670`
名称	SmilChr02G001670
描述	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	30959141 - 30961050 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013309`
GeneID	`131013309`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013309`
原始查询	`LOC131013309`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
产物	pre-mRNA-processing-splicing factor 8A-like
Arabidopsis	`AT1G80070` (SUS2) Pre-mRNA-processing-splicing factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844347] identity=89.5; qcov=0.995; evalue=1.22e-111; confidence=high
Rice	`Os06g0167000` - identity=93.4; qcov=0.953; evalue=5.06e-114; confidence=high
GO	GO:0000244 (spliceosomal tri-snRNP complex assembly); GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0005682 (U5 snRNP); GO:0017070 (U6 snRNA binding); GO:0030619 (U1 snRNA binding); GO:0030620 (U2 snRNA binding); GO:0030623 (U5 snRNA binding); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome); GO:0097157 (pre-mRNA intronic binding)
KEGG	-
Pfam	PF10596 (U6-snRNA_bdg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013309

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057797369.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797369.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057797369.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797369.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797369.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:30960185`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B47,B82
`Chr2:30960207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr2:30960233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,A8
`Chr2:30960245`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,B68
`Chr2:30960276`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B111,B80
`Chr2:30960281`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	30	A10,A2,B101,B106,B112,B115,B127,B132,B136,B26,B33,B53,B58,B61,B81,B85,B89,B93,C1,C24,C38,C4,C59,C67,C70,C74,C80,C83,D5,D6
`Chr2:30960378`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:30960382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B44
`Chr2:30960382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr2:30960410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,C16,C60,C61
`Chr2:30960425`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B30,C21,D8
`Chr2:30960437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797369.1

191 aa

191

U6-snRNA_bdg

PF10596 U6-snRNA_bdg 1-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797369.1`	Pfam	`PF10596`	U6-snRNA_bdg	Domain	1	79	8.4e-44	149.9	U6-snRNA interacting domain of PrP8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941386.1
TTTTCCCCCTTCGCCGCCAGCGATTCGGCGTCCTTGTTGCCGATTTTCAATTTTCCGGTCATCTTCTACGCAGATCTAGGGTTGAGCTTGAAGTGGAGGCACGGCGGTGGCACAATTCAGAGTTTCCCAGCATGGGAGGGTATTTTCTGGGAGAAGGCTTCTGGTTTTGAGGAGTCCATGAAGTACAAGAAGTTAACTAATGCACAAAGATCTGGTCTCAACCAAATTCCTAACAGAAGATTTACACTTTGGTGGTCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013309
ATGAAGTACAAGAAGTTAACTAATGCACAAAGATCTGGTCTCAACCAAATTCCTAACAGAAGATTTACACTTTGGTGGTCGCCGACTATAAACAGAGCAAACGTGTATGTTGGTTTCCAAGTCCAGCTGGATCTCACTGGGATCTTTATGCATGGGAAGATACCAACTCTGAAGATATCTCTGATCCAGATACATGAGAGTGTAGTGATGGATCTTTGTCAAGTTTTGGATCAGGAGCTGGATGCGTTGGAAATTGAGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797369.1
MKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIHESVVMDLCQVLDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFAAHRWPMSKPSLVAESKDVFDQKASNKYWIDVQLRWGYYDSHDIERYTRAKFMDYTTDNMSISFFTTCIVCLRLNQSLVL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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