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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001682`

染色体: Chr02 坐标: 31060222-31061972 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001682`
名称	SmilChr02G001682
描述	uncharacterized SmilChr02G001682
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31060222 - 31061972 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013315`
GeneID	`131013315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013315`
原始查询	`LOC131013315`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=30.5; qcov=0.668; evalue=1.43e-21; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797372.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797372.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797372.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797372.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057797372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31060802`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,A19,B101,B42,B43,B58,B64,B66,B78
`Chr2:31060805`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A11,A19,B101,B42,B43,B58,B64,B66,B78
`Chr2:31060851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:31060880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:31060903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr2:31060916`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B86,C49,D2
`Chr2:31060916`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B86,C49,D2
`Chr2:31060919`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B86,C49,D2
`Chr2:31060919`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B86,C49,D2
`Chr2:31060974`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr2:31060983`	`GTC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A19,B101,B114,B42,B43,B58,B64,B66,B78
`Chr2:31061030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797372.1

250 aa

125

250

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 27-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797372.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	27	122	7.3e-07	30.8	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941389.1
AAGTCTGCGATCGACACTCTCACACTAGAAAGAATTTGCGAAACCCTACCTTCAAACGAAATGAGCACCACCACTCAAGGAAGTAATAGAGTTCTTCAATGTGGTCGAACAAACAAGACCGACAAATCGAGACGCAGCTGGTTGATGCGTGATGAAGCGATTTTGTTGGCGTCGTTGAAGGAGTTGGTTGCTAATGGATGGAAATCAAATAACGGATTTCAGGCCGGGTACTTAACTAAGCTCGAAGAAGCTATGCGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013315
ATGAGCACCACCACTCAAGGAAGTAATAGAGTTCTTCAATGTGGTCGAACAAACAAGACCGACAAATCGAGACGCAGCTGGTTGATGCGTGATGAAGCGATTTTGTTGGCGTCGTTGAAGGAGTTGGTTGCTAATGGATGGAAATCAAATAACGGATTTCAGGCCGGGTACTTAACTAAGCTCGAAGAAGCTATGCGAAAGGAGTTCCCAACCACTGATTTGAAAGTCATGCCACACATAAACTCGAAGATTACCATATG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797372.1
MSTTTQGSNRVLQCGRTNKTDKSRRSWLMRDEAILLASLKELVANGWKSNNGFQAGYLTKLEEAMRKEFPTTDLKVMPHINSKITIWKKNYNSLTKMLKPSGVGFNLTGTHMIDCNDEQWEQIVKKDNNARLMRNKSWPYLDDWKEIFGKDRATGDVAEDVMEVAHEMYRNIDLAQPNVDGDYHVSLEDLSETADAADSVSETQQTNGEVRRVKKKRKSDDGFDRLIDAMVEITRTTDKRFEAITSRTGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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