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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001698`

染色体: Chr02 坐标: 31293790-31297449 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001698`
名称	SmilChr02G001698
描述	APO protein 4, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31293790 - 31297449 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013326`
GeneID	`131013326`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013326`
原始查询	`LOC131013326`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	APO protein 4, mitochondrial
产物	APO protein 4%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT3G21740` (APO4) APO RNA-binding protein (DUF794) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821728] identity=57.7; qcov=0.939; evalue=6.87e-128; confidence=high
Rice	`Os04g0628000` (OsISC40) - identity=54.5; qcov=0.985; evalue=8.35e-125; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF05634 (APO_RNA-bind)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013326

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797383.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057797383.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057797383.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057797383.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797383.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31295014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B28,C15,C79
`Chr2:31295858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,B63,B73,B83
`Chr2:31295906`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr2:31296268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B75,C60
`Chr2:31296307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B26
`Chr2:31296342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797383.1

330 aa

165

330

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 35-172 aa PF05634 APO_RNA-bind 204-314 aa

XP_057797385.1

330 aa

165

330

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 35-172 aa PF05634 APO_RNA-bind 204-314 aa

XP_057797386.1

330 aa

165

330

APO_RNA-bind

PF05634 APO_RNA-bind 35-172 aa PF05634 APO_RNA-bind 204-314 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797383.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	35	172	2e-60	204.4	APO RNA-binding
`XP_057797383.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	204	314	2e-60	204.4	APO RNA-binding
`XP_057797385.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	35	172	2e-60	204.4	APO RNA-binding
`XP_057797385.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	204	314	2e-60	204.4	APO RNA-binding
`XP_057797386.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	35	172	2e-60	204.4	APO RNA-binding
`XP_057797386.1`	Pfam	`PF05634`	APO_RNA-bind	Family	204	314	2e-60	204.4	APO RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009097639.1
GCCATCCATCGAACTGAACGCACCTTGAAAGTCTGAAACAGGCTTTCTCTCGTCTCCGACCTCTCTCTGCCGTCCATCGATCGCCGCCTCCGTTTCCTGTGGCCACGCCCCGCCTTGCCTCCTCGGAGCCTCCGTCCCAGCACCGCAAGAAGCAGCTAGCAGCAGTGCGCGATTGCGCCGCGCCACCGCCCTCGACCAGCCTTCCCCGTCGCGTCACCCTGCCCCGCCTCGGCGCCTCCGTCCGGAGACTCCGAAGCAAC...

XR_009097637.1
CGAACTGAACGCACCTTGAAAGTCTGAAACAGGCTTTCTCTCGTCTCCGACCTCTCTCTGCCGTCCATCGATCGCCGCCTCCGTTTCCTGTGGCCACGCCCCGCCTTGCCTCCTCGGAGCCTCCGTCCCAGCACCGCAAGAAGCAGCTAGCAGCAGTGCGCGATTGCGCCGCGCCACCGCCCTCGACCAGCCTTCCCCGTCGCGTCACCCTGCCCCGCCTCGGCGCCTCCGTCCGGAGACTCCGAAGCAACAGCATTTCC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131013326
ATGAACCCCGGCAATCTTAATCTATGGCGAATGAAATCCCTAATTCTCGAAGAAATGCTGAAAGGCCTGAGAAATTACAGCACGAAATCACGTCGGATGGTGGATTTGAGGAAGCTCAGGCCTATGATACTGAAGCGAATTGAGCAACGTGCTGAGGATTATCCTGTCAAACCCATACTTCCGGTGGCGCGTGAAGTCCTCCGTGCCCGAAGCGCCCTCTACAGTGGAGTGTCAACTCTCATCCGCCACATTCCGGTCTG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057797383.1
MNPGNLNLWRMKSLILEEMLKGLRNYSTKSRRMVDLRKLRPMILKRIEQRAEDYPVKPILPVAREVLRARSALYSGVSTLIRHIPVWACKYCPEAYIGEGGHLIQTCHGYRRHGTKKVHEWVNGSVDDIIVPVESFHLHKMFQNIIKHHERFDHQRVPAVVELCLQAGVDANDPSVTSSVITPANNEDNCSSSQSLSDDDLRLIGRQTLDAWEKLRSGVHKLLFVYPARVCKHCSEVHVGPSGHKARMCGVFKYESWHGT...

XP_057797385.1
MNPGNLNLWRMKSLILEEMLKGLRNYSTKSRRMVDLRKLRPMILKRIEQRAEDYPVKPILPVAREVLRARSALYSGVSTLIRHIPVWACKYCPEAYIGEGGHLIQTCHGYRRHGTKKVHEWVNGSVDDIIVPVESFHLHKMFQNIIKHHERFDHQRVPAVVELCLQAGVDANDPSVTSSVITPANNEDNCSSSQSLSDDDLRLIGRQTLDAWEKLRSGVHKLLFVYPARVCKHCSEVHVGPSGHKARMCGVFKYESWHGT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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