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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001709`

染色体: Chr02 坐标: 31488504-31493193 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001709`
名称	SmilChr02G001709
描述	proton pump-interactor 1-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31488504 - 31493193 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013336`
GeneID	`131013336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013336`
原始查询	`LOC131013336`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	proton pump-interactor 1-like
产物	proton pump-interactor 1-like
Arabidopsis	`AT4G27500` (PPI1) proton pump interactor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828859] identity=51.6; qcov=1; evalue=1.12e-158; confidence=high
Rice	`Os08g0390000` (BIP131) - identity=46; qcov=0.933; evalue=4.75e-127; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27883 (PPI_C); PF28572 (PPI_helical)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797391.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057797393.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797391.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797391.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797391.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31489556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B48
`Chr2:31489654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr2:31490701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31492284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C15,C79,D3
`Chr2:31492387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr2:31492406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B104
`Chr2:31492407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31492788`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31492907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31492927`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B47,B81,C15,C17,C31,C4,C57
`Chr2:31492940`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797391.1

522 aa

261

522

PPI_helical

PPI_C

PF28572 PPI_helical 68-374 aa PF27883 PPI_C 471-506 aa

XP_057797393.1

611 aa

306

611

PPI_helical

PPI_C

PF28572 PPI_helical 68-374 aa PF27883 PPI_C 471-506 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797391.1`	Pfam	`PF28572`	PPI_helical	Domain	68	374	2e-61	208.7	Proton pump-interactor helical domain
`XP_057797391.1`	Pfam	`PF27883`	PPI_C	Domain	471	506	7.2e-12	45.9	Proton pump-interactor C-terminal domain
`XP_057797393.1`	Pfam	`PF28572`	PPI_helical	Domain	68	374	3e-61	208.1	Proton pump-interactor helical domain
`XP_057797393.1`	Pfam	`PF27883`	PPI_C	Domain	471	506	8.8e-12	45.6	Proton pump-interactor C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941410.1
AAAATCAACATTTTGTTTTCACCCCCACCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACACACACACAAGCATAAAGATCTGGGGTCCTTTTCTCCCTCATAACACTCCCTTCGAATTCTCCGCTCAGTGTTGTTGCCATTTGCAGGAATCGAGATCTGCTTTATACCTTTTGACCTTAGCGGTGTCTACATATCATGGGTATGGAGGTCGTAGACTCTAAATTAGCCTTGGATGCTCTGAGTGAAACCGATGTGTC...

XM_057941408.1
GTTGTTGCCATTTGCAGGTATGTTACCGCCATATTCTTCGTTTTCTTAATTCCCTACTCCACTTTAATCTCCCTCCCCCTCTTATCAAAGCTTCAATATTTTATTATCCACGTATTACATTCTGATCCACCGATCTCGATCCATTTGAGGAATCGAGATCTGCTTTATACCTTTTGACCTTAGCGGTGTCTACATATCATGGGTATGGAGGTCGTAGACTCTAAATTAGCCTTGGATGCTCTGAGTGAAACCGATGTGTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131013336
ATGGGTATGGAGGTCGTAGACTCTAAATTAGCCTTGGATGCTCTGAGTGAAACCGATGTGTCGGCTGAAGTTGGAAAAGTTGACATAAAATTTGGCTCTCATGGTGCTGAGGAGCCGACTAAAGCTGTGGAACTGAATAAACTTTCGGAGTCCAATTTCCCTAAGGATGTGGTTGATGAGTGGCCTGAGCCCACACAGATTCACTCCTTCTACATTGTTAGATACCGAGCATTTGAAGACCAGAATCTGAAGGCCAAACT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057797391.1
MGMEVVDSKLALDALSETDVSAEVGKVDIKFGSHGAEEPTKAVELNKLSESNFPKDVVDEWPEPTQIHSFYIVRYRAFEDQNLKAKLDMADKDLQKKNQARSQIFEKLKTKRAERADVRTQIHSLSVENKQFRSVLDEKRKEMEPLQQALGKLRGSSGARDNRGSGVCSSEAELNDVIKSLQYRIQHESIPLSEEKQILREIKLLEGTREKVIANAAERARIQDSLGQKEDILDQVKSIGVDLDGVRKEKQVVFAKIKQL...

XP_057797393.1
MGMEVVDSKLALDALSETDVSAEVGKVDIKFGSHGAEEPTKAVELNKLSESNFPKDVVDEWPEPTQIHSFYIVRYRAFEDQNLKAKLDMADKDLQKKNQARSQIFEKLKTKRAERADVRTQIHSLSVENKQFRSVLDEKRKEMEPLQQALGKLRGSSGARDNRGSGVCSSEAELNDVIKSLQYRIQHESIPLSEEKQILREIKLLEGTREKVIANAAERARIQDSLGQKEDILDQVKSIGVDLDGVRKEKQVVFAKIKQL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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