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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G000149`

染色体: Chr01 坐标: 2554840-2563158 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G000149`
名称	SmilChr01G000149
描述	uncharacterized SmilChr01G000149
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	2554840 - 2563158 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013337`
GeneID	`131013337`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013337`
原始查询	`LOC131013337`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828223]; symbol=AT4G01880; hit=AT4G01880; species=arabidopsis; confidence=high
产物	methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828223]; symbol=AT4G01880; hit=AT4G01880; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G01880` (AT4G01880) methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828223] identity=62; qcov=0.889; evalue=7.4e-180; confidence=high
Rice	`Os03g0833200` (OsTRM13) - identity=49.3; qcov=0.434; evalue=2.29e-54; confidence=low
GO	GO:0030488 (tRNA methylation); GO:0106050 (GO:0106050)
KEGG	-
Pfam	PF05206 (TRM13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013337

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057797727.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797727.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797727.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797727.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:2554853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C86
`Chr1:2554855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr1:2554899`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B42
`Chr1:2554901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,C75
`Chr1:2554929`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C44,C86
`Chr1:2554962`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C8
`Chr1:2555716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B36,C42,C51,C6,C77
`Chr1:2555811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr1:2555836`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr1:2555882`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr1:2555882`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:2555997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797727.1

468 aa

234

468

TRM13

PF05206 TRM13 178-467 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797727.1`	Pfam	`PF05206`	TRM13	Family	178	467	1.8e-76	257.8	Methyltransferase TRM13

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941744.1
ATGAAACATCCACGCCTCTTCTCACCACCATTCTGTTGGGACGAGTCCTTAGAACCACCGGCATTGCCATTATTGGCTTTCTTCTTTTTCCAGCCATCTTTGCCTTTCCTTTCCTTCTCCTTCCCTTTGCCCAGAAATCACCATTCCGCTGGCAACCCAATCGACCCTTCTCACTCTGTGCTCGAGGAAAATCTCGAGACTCACTTGCATAGATGCCCATTGCTGAAACAAACACAGTCCCTCTCGCGCCAGCCTTACTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013337
ATGAAACATCCACGCCTCTTCTCACCACCATTCTGTTGGGACGAGTCCTTAGAACCACCGGCATTGCCATTATTGGCTTTCTTCTTTTTCCAGCCATCTTTGCCTTTCCTTTCCTTCTCCTTCCCTTTGCCCAGAAATCACCATTCCGCTGGCAACCCAATCGACCCTTCTCACTCTGTGCTCGAGGAAAATCTCGAGACTCACTTGCATAGATGCCCATTGCTGAAACAAACACAGTCCCTCTCGCGCCAGCCTTACTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797727.1
MKHPRLFSPPFCWDESLEPPALPLLAFFFFQPSLPFLSFSFPLPRNHHSAGNPIDPSHSVLEENLETHLHRCPLLKQTQSLSRQPYYQKGINAGDDDDEEKEEDSSHRYSTFTSEMKRNAVYSMPLPKFLDLIAKIKSIHASICSTIPDSYRIPEACSIWTNREVDKKLPYKEKHVLQQASMLGNLENFGVLRESCSSSGETSEEKDSKRERERDSDVPAVVEFGAGRGYLTQVLADCYGIKKVLLVERKSYKLKADRSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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