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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001714`

染色体: Chr02 坐标: 31524689-31528999 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001714`
名称	SmilChr02G001714
描述	uncharacterized SmilChr02G001714
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31524689 - 31528999 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013343`
GeneID	`131013343`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013343`
原始查询	`LOC131013343`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding S4 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841746]; symbol=AT1G53120; hit=AT1G53120; species=arabidopsis; confidence=high
产物	RNA-binding S4 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841746]; symbol=AT1G53120; hit=AT1G53120; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G53120` (AT1G53120) RNA-binding S4 domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841746] identity=70.1; qcov=0.873; evalue=5.07e-149; confidence=high
Rice	`Os01g0747700` - identity=61.5; qcov=0.944; evalue=4.84e-134; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01479 (S4); PF17774 (YlmH_RBD); PF21278 (YlmH_1st)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013343

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057797396.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057797396.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797396.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797396.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31524954`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr2:31525612`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A9,B104,D1
`Chr2:31526329`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B28,C15,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797396.1

322 aa

161

322

YlmH_1st

YlmH_RBD

PF21278 YlmH_1st 78-144 aa PF17774 YlmH_RBD 157-227 aa PF01479 S4 247-293 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797396.1`	Pfam	`PF21278`	YlmH_1st	Domain	78	144	9.8e-34	115.6	YlmH, N-terminal
`XP_057797396.1`	Pfam	`PF17774`	YlmH_RBD	Domain	157	227	5.6e-14	52.9	Putative RNA-binding domain in YlmH
`XP_057797396.1`	Pfam	`PF01479`	S4	Domain	247	293	8.7e-10	38.9	S4 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941413.1
GGACAAAACAAAAACATAATCATATTTATAATTATACGTAGGAAAGTGATTAAAAAAGTAGTAGGAGTATGTAATTAAAAATATCTATTGTCGAAAATAACTTGTTTGACTGCAGAAGCTCTAAATTGGATACCGAGTTTCATTCCAAATCGGGTTGCCTATCCAATTGAATACGGGCCGGGTTTGTCCGGCAAATTGTCATCGACGGGTAGAATGTGGGCGCTACGCGCCTCGGCCATGGCCGGCGCCGGCGCTGCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013343
ATGTGGGCGCTACGCGCCTCGGCCATGGCCGGCGCCGGCGCTGCCGCGCAAGCTTTCATCCGAAGGGCAGTTCCTTCATCTCATTCTCTTCGTTCAATTAATCTCACTAGCTTCAGAACTTCCCCTCTAATCGCTCCCTTCACTCCCTCAGCTCTGGACATTTGCCCCCCACCACAGGCTGCTAAGAGTAAAGCAGATGTTCTCGTCAATGGGGTGGGAGATAAGGATACGGTTGAAGATGTCAAGAGAATTCTTGAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797396.1
MWALRASAMAGAGAAAQAFIRRAVPSSHSLRSINLTSFRTSPLIAPFTPSALDICPPPQAAKSKADVLVNGVGDKDTVEDVKRILEMANRASLRRETLHTDFLTPPVLKESMLALEKIADIKMVAQGGYPEAERCRLSVGHPDILTSDPDIVAALCISGNFGFESCTHGDFLGAIVGTGIVRDKLGDIILQGEKGAQILVVPELVDFLISSLDKVRNVSVTCKKIPLLALEYQPPRTKSLKTVEASQRLDAIASAGFKIS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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