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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G001715`

染色体: Chr02 坐标: 31590980-31592222 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G001715`
名称	SmilChr02G001715
描述	VQ motif-containing protein 4-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	31590980 - 31592222 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013344`
GeneID	`131013344`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013344`
原始查询	`LOC131013344`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	VQ motif-containing protein 4-like
产物	VQ motif-containing protein 4-like
Arabidopsis	`AT1G28280` (AT1G28280) VQ motif-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839722] identity=51.6; qcov=1.1; evalue=1.24e-50; confidence=medium
Rice	`Os01g0747800` (OsVQ3) - identity=48.4; qcov=0.892; evalue=1.84e-39; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05678 (VQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013344

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797397.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797397.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057797397.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797397.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797397.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:31591507`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B33,B34,B46,C39,C41
`Chr2:31591507`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B33,B34,B46,C39,C41
`Chr2:31591509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B49,B52
`Chr2:31591510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B124,B76,D10,D4
`Chr2:31591511`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B14
`Chr2:31591511`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B14
`Chr2:31591515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr2:31591529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B86,B96
`Chr2:31591535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,B96
`Chr2:31591551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,D10,D4
`Chr2:31591555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,A22,B122,D4
`Chr2:31591557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797397.1

204 aa

102

204

PF05678 VQ 55-80 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797397.1`	Pfam	`PF05678`	VQ	Motif	55	80	2.5e-10	40.4	VQ motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941414.1
TTTAAGTATGTCTTGACTTAAAAAAAAATTGATTGGATTTATTCATAAAAAAGAAAAGTGAGACGTTAGAAGTTTGAATAGGAGAGAGTTAATGCGTGAAGTGAAAGAAATGAGGTGGATGGTTGCATGAAGGAGTGGGTTTGGGTTAAGGAATTTTGAGTAGTTGGAAAATTATGGAGCTCTTTTTTGGTGTTTAGGCCACTCTTTCTTTATGTAGAAGACCGTTAGAATGGAAGCTACATTTTCTGGTTGCCCAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013344
ATGGAAATGGCCTCTCCCTCATCAAGAGAGAACCCATCTCCTTCTCCGACCAACTCCCCCCACAGCAATGGCAGCTCGAGCAGCAGCAGCAACGGCTCCTCCCTCCACCTCCCCACCCCACCCCCCACCCCGACCCTGAAGCCCAGATCCCACGAAGCCAATCCCTACCCGACCACCTTCGTCCAGGCCGACACCACCACCTTCAAACAGGTGGTGCAAATGCTCACCGGATCTTCCAAACCGGGCTGCGGCGGCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797397.1
MEMASPSSRENPSPSPTNSPHSNGSSSSSSNGSSLHLPTPPPTPTLKPRSHEANPYPTTFVQADTTTFKQVVQMLTGSSKPGCGGGIPPIKSTGQKKQGFKLYERRNSIKNGLMINTFVPGPARNSNSPRKPEILSPSILDFPSLVLSPVTPMNEDRAAADQEERAIAEKKFYFHPSPRTAPDPPQLLPLFPVTSPRVSGASTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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