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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002264`

染色体: Chr02 坐标: 40085942-40090945 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002264`
名称	SmilChr02G002264
描述	nuclear/nucleolar GTPase 2
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40085942 - 40090945 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013388`
GeneID	`131013388`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013388`
原始查询	`LOC131013388`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear/nucleolar GTPase 2
产物	nuclear/nucleolar GTPase 2
Arabidopsis	`AT1G52980` (AtNug2) GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841731] identity=78.4; qcov=0.979; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0352400` (OsNug2) - identity=77.5; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005525 (GTP binding); GO:0005730 (nucleolus)
KEGG	smil03008 (Ribosome biogenesis in eukaryotes - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF01926 (MMR_HSR1); PF08153 (NGP1NT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013388

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797440.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057797440.1`
3	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.20000	`XP_057797440.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797440.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057797440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40086131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B99
`Chr2:40086151`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A13,B108,B140,C12,C23,C57
`Chr2:40087618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B41,B51
`Chr2:40088567`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D1
`Chr2:40088618`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B29,D1
`Chr2:40090655`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,B32
`Chr2:40090655`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,B32
`Chr2:40090657`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B104,B32
`Chr2:40090769`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797440.1

524 aa

262

524

NGP1NT

MMR_HSR1

PF08153 NGP1NT 44-169 aa PF01926 MMR_HSR1 311-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797440.1`	Pfam	`PF08153`	NGP1NT	Domain	44	169	9.9e-47	159.1	NGP1NT (NUC091) domain
`XP_057797440.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	311	370	7.9e-19	68.6	50S ribosome-binding GTPase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941457.1
TCATATCACCGCCGCTCCCCTCATTCCTCTCATATCACCGCACTGTTTGTGGCGGCGATATCATTTTCGGCAACCATGGCAAAGAAGAAGGAGAGGTCCGTCAACGTTTCGGGGAAGCCGAAGCACTCGCTCGATGTCAACAGAGATAATAGCAAAGGCAAATCTAGCAATGGCCGGAGCGCCGCCACAGTGCGGCGCCTCAAGATGTACAACACGCGCCCCGTCCGCAACGCTGGCGGAAAAATCCTCAAGCACGACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013388
ATGGCAAAGAAGAAGGAGAGGTCCGTCAACGTTTCGGGGAAGCCGAAGCACTCGCTCGATGTCAACAGAGATAATAGCAAAGGCAAATCTAGCAATGGCCGGAGCGCCGCCACAGTGCGGCGCCTCAAGATGTACAACACGCGCCCCGTCCGCAACGCTGGCGGAAAAATCCTCAAGCACGACCTCCAGTCCAAGGAATTGCCGTCTACTCGGATTATGCCTGATCGTCGCTGGTTCGGCAACACACGTGTTGTGAATCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797440.1
MAKKKERSVNVSGKPKHSLDVNRDNSKGKSSNGRSAATVRRLKMYNTRPVRNAGGKILKHDLQSKELPSTRIMPDRRWFGNTRVVNQKELEYFREELQNRLSSSYNVLLKERKLPMSLLNDHQKQARVHLLDTQPFTDAFGPKTKRKKPKLLASDYESLVKRADGSQDAFGEKHGASTSTEGDEDGFRDLVRHTMFEKGQSKRIWGELYKVIDSSDVVVQVLDARDPQGTRCYHLEKHLKANCKHKHMILLLNKCDLVPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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