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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002274`

染色体: Chr02 坐标: 40198518-40205211 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002274`
名称	SmilChr02G002274
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40198518 - 40205211 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013393`
GeneID	`131013393`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013393`
原始查询	`LOC131013393`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24
产物	probable ubiquitin-conjugating enzyme E2 24
Arabidopsis	`AT2G33770` (PHO2) phosphate 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817943] identity=45.9; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0557700` (LTN1) - identity=44.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
GO	-
KEGG	smil04120 (Ubiquitin mediated proteolysis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00179 (UQ_con); PF23043 (SH3-B_UBE2O); PF23046 (tSH3-B_UBE2O)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013393

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797444.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797444.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057797444.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797444.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40198785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B137,B76,C62,D8
`Chr2:40198887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,D7
`Chr2:40198939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B137,B76,C62,D8
`Chr2:40198978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr2:40198995`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:40199304`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B36,B51
`Chr2:40199373`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr2:40199451`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:40199608`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr2:40199629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B108,B5,B71,C24
`Chr2:40200109`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:40200889`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797444.1

906 aa

453

906

tSH3-B_UBE2O

SH3-B_UBE2O

UQ_con

PF23046 tSH3-B_UBE2O 107-234 aa PF23043 SH3-B_UBE2O 320-393 aa PF00179 UQ_con 662-794 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797444.1`	Pfam	`PF23046`	tSH3-B_UBE2O	Domain	107	234	8.1e-38	129.9	UBE2O, tandem tSH3-B domain
`XP_057797444.1`	Pfam	`PF23043`	SH3-B_UBE2O	Domain	320	393	1.7e-17	64.3	UBE2O, SH3-B domain
`XP_057797444.1`	Pfam	`PF00179`	UQ_con	Domain	662	794	5.8e-22	78.5	Ubiquitin-conjugating enzyme

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941461.1
GTTTCTTGGTCTTCTGTAGTTATTCTTGGCCCAAGTTGAAAACAAAAGAAATAATCGTTGTGGTCATCAAGATTTCAAGCAAGGGCTATCTCCTAGTTTAGCTCGATCATTCTCTATTTGTGCAGCAAATCCACCTCTTTTGGCATCGAGTAGTGCAATGACTTGGTGAATTGGGGTGGAGGGCAAATCTCATTTGGCAATTTGTACTTGGCTTTTGAAGAAGAAAGAAGATTTCTTCAAAGCCCTTTAGCAATACATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013393
ATGGATTCGTTGCATAGCGACTTTGACAGTTTCAGTGAGAGCAGCAGTTCCGAGGATCAGGAGGACATTGAATTTCTGTATGGTCCACAGGCCTGCAACATTTTCTCGTCGCTTGAGGATTCCATCCAAAAGATAGACGATCTTCTCATGTTCGAGAGAGGATTCATGAATGGCGATGTGGTTTGCCTGGTTTCAGATCCATTAGGACAAATGGGAAAGGTTGTCAATGTGGACATGACCGTGGATTTGGAAAATATGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797444.1
MDSLHSDFDSFSESSSSEDQEDIEFLYGPQACNIFSSLEDSIQKIDDLLMFERGFMNGDVVCLVSDPLGQMGKVVNVDMTVDLENMFGTKTQNVDSKHLQKIQSVSVGDCVIFGPWLGKVEKVVDRVSILFDDGTKCQLNAEGPERIVALSQDFTEDLPYPFYPGQRVRVESSVSRSTRWLCNIRKDKHEQGTVCDVDAGLVYVDWLCCAVSSVKKGPTPPCLQDVKNLSVLPCGQTNWQLGDWCVLPIEQSLPCSYASG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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