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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002288`

染色体: Chr02 坐标: 40417063-40422432 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002288`
名称	SmilChr02G002288
描述	uncharacterized SmilChr02G002288
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	40417063 - 40422432 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013403`
GeneID	`131013403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013403`
原始查询	`LOC131013403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lsd one like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828248]; symbol=LOL2; hit=AT4G21610; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	lsd one like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828248]; symbol=LOL2; hit=AT4G21610; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT4G21610` (LOL2) lsd one like 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828248] identity=52.8; qcov=0.285; evalue=1.54e-32; confidence=weak
Rice	`Os01g0612700` (LOL5) - identity=61.2; qcov=0.228; evalue=3.12e-32; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF06943 (zf-LSD1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057797461.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057797461.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057797461.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797461.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797461.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:40417323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B36,B51,B72
`Chr2:40418487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr2:40418501`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B53,D1
`Chr2:40418517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C14
`Chr2:40421779`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797461.1

372 aa

186

372

zf-LSD1

PF06943 zf-LSD1 278-301 aa PF06943 zf-LSD1 316-340 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797461.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	278	301	2.1e-15	57.0	LSD1 zinc finger
`XP_057797461.1`	Pfam	`PF06943`	zf-LSD1	Domain	316	340	2.1e-15	57.0	LSD1 zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941478.1
GGTAATCTATTCTATAGTCCCATCGTTTGCGGGACTTAAAACAAATCAAACCTGAATTTAATTAATTAATAGGTTTATTTGTGAATATTTACTTCGGCGTTACATAAAAACCCAACCTAAGAAAACTCTTATCAGCAGAGAGATGGTTGAAGAAGAGGAGGAAATAGTAGCAGCAGCTGTTAATGCCGCAGAAGAAGACGACGACGACGATGACGGGCCACCGCCTGGATTTCAGTGCATCCTAACTCTACAGCCACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013403
ATGGTTGAAGAAGAGGAGGAAATAGTAGCAGCAGCTGTTAATGCCGCAGAAGAAGACGACGACGACGATGACGGGCCACCGCCTGGATTTCAGTGCATCCTAACTCTACAGCCACCGCCGCCAGAGAACGACGACGAAGAAGAGGATGGCCCACCGCCTGGATTCGACTTCGTCGCCCCCAAACCCCTTCCATTGCTTCCGTCTTCTGATATGGAAAGCAGCAAAAAAGATGACATGGACGACGATGATGATGATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797461.1
MVEEEEEIVAAAVNAAEEDDDDDDGPPPGFQCILTLQPPPPENDDEEEDGPPPGFDFVAPKPLPLLPSSDMESSKKDDMDDDDDDDDGPPPGWEFGKIVNALPNTTSGLSSPATPPPQQLPSSEQPSDIKEESNEELDEGPPPGWESVLPCQMPQPQTPPLQPPSTVSSNSEMGSKQKTVEMDNEVPQSESEQTPTPGWSSPATPPPQQLPSSEQPSDTGNKEEEKKNEEKRPTSVHQPTSPRQQLQSSPLQQLQSNPRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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