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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002340`

染色体: Chr02 坐标: 41115239-41116015 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002340`
名称	SmilChr02G002340
描述	protein E6-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41115239 - 41116015 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013456`
GeneID	`131013456`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013456`
原始查询	`LOC131013456`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein E6-like
产物	protein E6-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30986 (E6-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013456

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057797530.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057797530.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797530.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797530.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797530.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41115450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr2:41115501`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	23	A10,A16,A20,A4,B106,B11,B110,B118,B128,B135,B3,B56,B72,B93,C10,C13,C29,C3,C31,C44,C5,C50,C68
`Chr2:41115508`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	25	A10,A16,A20,A4,A7,B106,B110,B118,B128,B135,B15,B3,B55,B56,B72,B93,C10,C13,C29,C3,C31,C44,C5,C50,C68
`Chr2:41115510`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A10,A16,A20,A4,A7,B106,B110,B118,B128,B135,B3,B55,B56,B72,B93,C10,C13,C29,C3,C31,C44,C5,C50,C68
`Chr2:41115519`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B127,B135,B20,B72,B74,B82,B89,B95,C27,C44,C45,C49,C72
`Chr2:41115542`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	B11,B128,B15,B20,B72,C3,C5,C50,C68
`Chr2:41115613`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr2:41115620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B1,B68,C5
`Chr2:41115628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,A9,B1,B68,C5
`Chr2:41115635`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B68,C5
`Chr2:41115637`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B68,C5
`Chr2:41115648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797530.1

183 aa

183

E6-like

PF30986 E6-like 1-98 aa PF30986 E6-like 82-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797530.1`	Pfam	`PF30986`	E6-like	Family	1	98	3.1e-23	84.0	E6 cell wall protein
`XP_057797530.1`	Pfam	`PF30986`	E6-like	Family	82	178	3.1e-23	84.0	E6 cell wall protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941547.1
AATTTGGAAGATGTTCACAATCACTAACTACACTCTCTCCTAAAATGGCTTCCTCCACCAATCAATTTTGTCTCTTCCTTCTCCTCCTCACACTCTCTTCCTCGCTCCACACTCATGCAAGAGACAGCCAATTCTTCAACAAAGCCTCCGCCATCCCCACCACCGCAACCGCCGTCCCCGACGCCCAACAACCCAATTTCCTCCCCGAAGACGAAAACAGCTACGGCCTCTACGCCCACCACTCCATCCCCACCGCGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013456
ATGGCTTCCTCCACCAATCAATTTTGTCTCTTCCTTCTCCTCCTCACACTCTCTTCCTCGCTCCACACTCATGCAAGAGACAGCCAATTCTTCAACAAAGCCTCCGCCATCCCCACCACCGCAACCGCCGTCCCCGACGCCCAACAACCCAATTTCCTCCCCGAAGACGAAAACAGCTACGGCCTCTACGCCCACCACTCCATCCCCACCGCGGCACAACCGCACCTCCCCAAGAACTACAACCCGGTGGCCTACGTCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797530.1
MASSTNQFCLFLLLLTLSSSLHTHARDSQFFNKASAIPTTATAVPDAQQPNFLPEDENSYGLYAHHSIPTAAQPHLPKNYNPVAYVTLPEHTNNKYNGGFNSAGDFQPQGMSDTRFLESGKYFYDLNTEKYSSNHPYEILREDQTRNGFYNKNFYGNSENAYEFNGEGYQTQDEFEDEVNNLP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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