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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G005942`

染色体: Chr01 坐标: 75155766-75158354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G005942`
名称	SmilChr01G005942
描述	receptor-like protein 54
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	75155766 - 75158354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013478`
GeneID	`131013478`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013478`
原始查询	`LOC131013478`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like protein 54
产物	receptor-like protein 54
Arabidopsis	`AT3G24982` (RLP40) receptor like protein 40 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822091] identity=35.8; qcov=1.01; evalue=9.45e-115; confidence=medium
Rice	`Os12g0215950` - identity=36.6; qcov=0.934; evalue=3.93e-126; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00560 (LRR_1); PF08263 (LRRNT_2); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013478

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797553.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797553.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797553.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797553.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:75155858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr1:75155943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr1:75155948`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B21,C84
`Chr1:75155980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr1:75155988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C49
`Chr1:75156025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr1:75156033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,B125
`Chr1:75156114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B58
`Chr1:75156242`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B65,C32
`Chr1:75156242`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B65,C32
`Chr1:75156292`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C60
`Chr1:75156309`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,B36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797553.1

862 aa

431

862

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PF08263 LRRNT_2 30-70 aa PF00560 LRR_1 100-123 aa PF00560 LRR_1 252-274 aa PF00560 LRR_1 331-344 aa PF00560 LRR_1 382-400 aa PF00560 LRR_1 451-471 aa PF00560 LRR_1 474-493 aa PF00560 LRR_1 496-515 aa PF00560 LRR_1 522-543 aa PF13855 LRR_8 658-710 aa PF00560 LRR_1 675-697 aa PF00560 LRR_1 699-721 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	30	70	4e-06	27.7	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	100	123	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	252	274	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	331	344	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	382	400	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	451	471	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	474	493	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	496	515	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	522	543	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	658	710	2.4e-37	127.2	Leucine rich repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	675	697	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797553.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	699	721	1.9e-49	155.6	Leucine Rich Repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941570.1
ATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCGTCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCTTATAATACCCAATGTCTTCACCATCAGAAAATCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGCTTCAATTCTTCTCGTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATCAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGACTGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCGTGAGTTCATTTCTGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013478
ATGCTTCCAAAGTTGTTCTTCGTCATTTCTACACTAATTTCCTCCTTCATTTTCACTACTCATTCTTATAATACCCAATGTCTTCACCATCAGAAAATCTTGTTGCTTCAACTCAAGGATGAGTTGAGCTTCAATTCTTCTCGTTCAACAAAATTGGTGCGATGGAATCAAAGTGATGAGTGCTGCAAGTGGCCCGGTGTGGACTGTGATGCTGCTGGCTACGTCGTTAGTTTGCAGCTCGATCGTGAGTTCATTTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797553.1
MLPKLFFVISTLISSFIFTTHSYNTQCLHHQKILLLQLKDELSFNSSRSTKLVRWNQSDECCKWPGVDCDAAGYVVSLQLDREFISGGIADSSSLFRLVHLQKLNLAHNYFNNTPIPKGIHNLTYLTHLNLSYADFGGQVPAEISSLRRLVSLYISSDYPISVKLEMLVQNLTGLRELYLDDVNVTSSHERRKWSHIIASYLPNLTALRMSFCGLSGPLTKSFGQLHSLSILRLDFNDLGTELPDLFANFPSLTTLSLRF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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