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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002384`

染色体: Chr02 坐标: 41787475-41788302 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002384`
名称	SmilChr02G002384
描述	dof zinc finger protein DOF1.5-like
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	41787475 - 41788302 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013495`
GeneID	`131013495`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013495`
原始查询	`LOC131013495`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF1.5-like
产物	dof zinc finger protein DOF1.5-like
Arabidopsis	`AT1G29160` (AT1G29160) Dof-type zinc finger DNA-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839790] identity=60.1; qcov=1.03; evalue=2.21e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0264000` (RDD1) - identity=68.3; qcov=0.488; evalue=6.73e-35; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013495

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797585.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057797585.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057797585.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797585.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797585.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:41787800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,B29
`Chr2:41787853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,C27,C41,C44,C71
`Chr2:41787858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B8,C18,C60
`Chr2:41787943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr2:41787961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:41787992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	16	B119,B25,B58,B61,B64,B77,B81,B97,C20,C24,C46,C53,C56,C65,C73,D11
`Chr2:41788026`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C16,C33
`Chr2:41788050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr2:41788057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B25,C80
`Chr2:41788069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr2:41788073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B25,C80
`Chr2:41788115`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797585.1

168 aa

168

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 52-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797585.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	52	107	7.1e-33	113.3	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941602.1
AATAGAGATTTCCGTGTGATATGCACCAAAACCCTCTCCGTCAAGATCAACCATGCACTTTTCTTCTTCACTCTAAATCATTTTATCAACTTATAAAGTACCCCACACCCCCCCCCCCACCCCACCCCGGTGTTTCCGGTTCACTTTTTCGCTTTTTTGAAGCATATATTCATACTTGCAGTTCCATACAATTTTCTTCACCAAGCTTCTCATCAATCACCTCTCTCTCTCATACATGGCTCAAGTCCAAGAAAACAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013495
ATGGCTCAAGTCCAAGAAAACAACGCCTCATCAGGGATCAAGTTATTCGGAGCCACAATCTCACCCAAAGAAAGATCACAGCCAAAAGCCGATCACGATCACAATAATCAGACGGCGCAGAAATCCGATCCGACGGCGGAGAAGCGACCGGACAAGATCATCCCTTGCCCTCGGTGCAAGAGCATGGAGACCAAATTCTGCTACTTCAACAACTACAACGTCAACCAGCCGCGCCACTTCTGCAAGGGCTGCCAGCGCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797585.1
MAQVQENNASSGIKLFGATISPKERSQPKADHDHNNQTAQKSDPTAEKRPDKIIPCPRCKSMETKFCYFNNYNVNQPRHFCKGCQRYWTAGGALRNVPVGAGRRKAKPPCLQPAFSEGCLFDPSSAGVQQLDFDAVVAMGEWQAADHAGFRHLFPGKRRRCAPNSQTC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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