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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002422`

染色体: Chr02 坐标: 42191591-42196056 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002422`
名称	SmilChr02G002422
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g45780
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42191591 - 42196056 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013523`
GeneID	`131013523`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013523`
原始查询	`LOC131013523`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g45780
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g45780
Arabidopsis	`AT5G45780` (AT5G45780) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834618] identity=68.1; qcov=0.976; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0236100` (Docs1) - identity=64.4; qcov=0.973; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013523

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057797617.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057797617.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797617.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057797617.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057797617.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42192958`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	218	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A21,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B103,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B21,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C51,C52,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C83,C85,C87,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr2:42193374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B45,B90,C12,C13
`Chr2:42193966`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D9
`Chr2:42194540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D9
`Chr2:42194786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr2:42194972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B83
`Chr2:42195487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C43
`Chr2:42195488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B91,C20,C43,D2
`Chr2:42195503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr2:42195589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B26,B40,B41,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797617.1

624 aa

312

624

LRRNT_2

LRR_14

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 31-70 aa PF23598 LRR_14 92-177 aa PF00560 LRR_1 98-120 aa PF00560 LRR_1 123-142 aa PF00560 LRR_1 147-168 aa PF00560 LRR_1 171-190 aa PF00069 Pkinase 301-572 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 302-573 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	31	70	7.9e-09	36.4	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	92	177	2.1e-12	47.2	Leucine-rich repeat region
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	98	120	7.3e-14	49.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	123	142	7.3e-14	49.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	147	168	7.3e-14	49.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	171	190	7.3e-14	49.6	Leucine Rich Repeat
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	301	572	7.8e-41	140.9	Protein kinase domain
`XP_057797617.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	302	573	4.8e-42	144.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941634.1
ATAAGCCAGACAAAGAGGGAGAAATTGCAAAAGAGAAAGAGCGAAGACTATCGCCTTAAATCTCGTAGAATCCATACGTTCAAGGATAACATCTGCATCCCTCTAAAAGAAAGGGATAATCTGCAGACTGCAGCTAATGCTCTAAAAAACATAATTAATTGAAAATAAAATGTTTTATAATTTGACTCTGATGTCTTGAGAAATGTATCACTGCAGCTGAAGACTTAGAAATAGCAAAGACAAAACCAAAAGTGGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013523
ATGAGAGAAATAGGGTTAGCATTGTTGCTAACTATTTTCTGGGCTAATAGTGTTGTTTGCTCTTCCAGTCTTCTTTCACCTAAAGGTGTCAACTTTGAAGTTGCTGCTCTGATGGGTATGAAGAGAGAGATGAGAGATGAAAACCATGTTCTTGATGGATGGGATATCAACTCTGTGGACCCTTGCACTTGGTACATGGTTGGCTGCTCTGCAGAAAGCTTTGTCATTTCTTTAGAAATGCCTAGCATGGGATTATCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797617.1
MREIGLALLLTIFWANSVVCSSSLLSPKGVNFEVAALMGMKREMRDENHVLDGWDINSVDPCTWYMVGCSAESFVISLEMPSMGLSGTLSPSIGNLTHLRTMLLQNNQLSGNIPSEIGKLSELQTLDLSGNKFDGGIPGSLGLLARLSYLKLSKNKLSGQIPRDVANLTGLSVLDLSFNNLSGPIPKILAKDYSVAGNVFLCSSNSQICMAAPKPLNETTSYPNFIRHHQHHHHHHLVAAVVAGVSCAFLVSILLLLCWV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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