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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr02G002421`

染色体: Chr02 坐标: 42182992-42187865 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr02G002421`
名称	SmilChr02G002421
描述	shaggy-related protein kinase eta
染色体 / SeqID	Chr02 / NC_080388.1
坐标与链方向	42182992 - 42187865 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131013524`
GeneID	`131013524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131013524`
原始查询	`LOC131013524`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	shaggy-related protein kinase eta
产物	shaggy-related protein kinase eta
Arabidopsis	`AT4G18710` (BIN2) Protein kinase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827605] identity=88.5; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0207500` (GSK2) - identity=84.6; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0007165 (signal transduction)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131013524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057797618.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057797618.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057797618.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057797618.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057797618.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr2:42184573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr2:42184862`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B130,B54,C81
`Chr2:42185081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B62,C34,C82
`Chr2:42185528`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr2:42186663`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057797618.1

382 aa

191

382

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 41-324 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 43-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057797618.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	41	324	3.3e-63	214.3	Protein kinase domain
`XP_057797618.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	43	241	1.3e-27	97.5	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057941635.1
AGGCAAGGCATCGTAAATAAAGTGGAAACCAAGGTGGTTCTCCGCCCAACTATTTCCTCAAACATAAGAAAAAGGAGAAAGAAAAAAGAGGAGAGAGAAAGAGAGAGGGAGAGTCAGAGAGCTGTAATCACATGGGATGCTGTTTGGTTTGTGGGTCCCAGCATCCCTACCCCACCCCCACCACCACCACCACCACCCTCCTCTAACCACGCCTCTCTCCTCTTTTTCTCTTTCTCTCTCTCCCTAATTGTGTTCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131013524
ATGGCCGACGATAAGGAGATGTCTGCTCCTGTGATGGATGGGAATGGCACAGTCACTGGTCACATAATTTCGACTACCATTGGGGGAAAGAATGGGGAACCTAAGCAGACAGTTAGTTACATGGCGGAGCGAGTTGTAGGGACTGGTTCATTTGGAATTGTTTTTCAGGCAAAATGCATTGAAACTGGAGAGACTGTGGCTATAAAAAAGGTTTTGCAAGACAGAAGATATAAAAATCGTGAACTGCAGTTAATGCGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057797618.1
MADDKEMSAPVMDGNGTVTGHIISTTIGGKNGEPKQTVSYMAERVVGTGSFGIVFQAKCIETGETVAIKKVLQDRRYKNRELQLMRTMDHPNIVSLKHCFFSTTSQNELFLNLVMEYVPESMFRVLKHYSDANQKMPLIYVKLYTYQIFRGLAYMHSVAGVCHRDLKPQNVLVDPSTHQVKICDFGSAKVLVRGEANISYICSRFYRAPELIFGATEYTTSIDIWSAGCVLAELLLGQPLFPGENAVGQLVEVIKVLGTP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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